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AFLP  遺傳標記技術服務
您只要提供原始樣本,反饋給您:01矩陣;聚類分析;多樣性分析;
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最后更新:2022-2-8半年訪問:27
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AFLP 技術服務
 
AFLP標記技術是1993年由荷蘭的Zabeau和Vos博士提出并完善的。現已廣泛應用于生物多樣性,指紋圖譜的構建,遺傳圖譜的構建,基因克隆等諸多研究領域,顯示了廣闊的應用前景。AFLP與其他分子標記相比具有:1、DNA 用量少;2、可重復性好;3、多態性強;4、分辨率高;5、樣品適用性廣,6、對基因組序列信息依賴性低等優點。在物種的多態性分析中獲得廣泛的應用。AFLP的選擇擴增產物目前主要通過兩種方法進行分離檢測,傳統的聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的方法和自動化程度較高的毛細管凝膠電泳進行檢測。
PAGE方法主要是AFLP的選擇擴增產物經過聚丙烯酰胺凝膠電泳得到分離,然后通過銀染將條帶顯現出來,然后通過照相得到相應的圖片,優點是引物可以是普通引物,價格相對較低,做少量樣本或者大量樣本的引物篩選比較合適,另外還可以對差異條帶進行克隆測序,獲得差異條帶的序列信息。
毛細管電泳檢測方法的優點是自動化,可以對大量樣本進行實驗,速度快,后期的條帶讀取可以依靠軟件,降低了人為讀取的標準不一。
1)AFLP實驗路線
前期確認階段:試驗樣本類型,數量,引物,簽訂試驗合作合同;
試驗階段:DNA提取,酶切,預擴增,選擇性擴增,電泳檢測;若需要克隆,進行目的條帶的回收并測序(周期視工作量而定);
數據分析:和客戶詳細溝通,確認分析方案:讀取01矩陣;聚類分析;多樣性分析;多態位點數(AP) 、多態位點百分率( P) 、平均等位基因數(N a) 、有效等位基因數(N e) 、Nei′s基因多樣性指數(H) 、Shannon′s信息指數( I) 、遺傳分化度(Fst)等。利用NTSYS進行聚類分析。
2目前已經進行的樣本類型樹木,草,花卉,昆蟲,魚類,蝦類,真菌
3)客戶須知:
本公司需要簽訂技術服務合作合同;
本公司再試驗結束后,如沒要求,試驗樣本將統一銷毀;
本公司不接受具有致病性和潛在危險的原始樣本,此類樣本請您提供樣本DNA。。
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

圖1 PAGE檢測引物篩選圖
 

圖2 毛細管電泳檢測大量樣本圖
 
圖4 序列測定
 
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