小鼠表型組數據庫簡介
但是，作為全球最常用的實驗室小鼠近交品系，C57BL/6小鼠其實還有許多不為人知的秘密！
您知道這一品系的雄性小鼠在接受5周的游泳訓練后平均可以游591分鐘嗎？
（圖源：電影《精靈鼠小弟》）
您知道C57BL/6雄性和雌性小鼠會比其他品系自行攝入更多的乙醇（即酒精）嗎？
如果您未曾了解過，快來查看小鼠表型組數據庫吧 (Mouse Phenome Database, MPD)！這里的豐富信息可能對您的研究大有幫助。
小鼠表型組數據庫（Mouse Phenome Database，MPD）是由美國國立衛生研究院資助并由杰克森實驗室維護的實驗小鼠品系特征的網站，是致力于促進人類健康和疾病的轉化研究的免費生物信息學資源。
在MPD上，你可以找到多個品系實驗小鼠的基因型數據、表型數據、詳盡的數據采集方法以及在線數據分析工具。
https://phenome.jax.org
帶您認識MPD
MPD涵蓋了超過447個JAX不同小鼠品系的數據，其中包括46種最常用的近交系小鼠。
我們為這些品系中的每一種都準備了全面的生理數據總結，匯總了研究人員最常關注的數據。這些數據也為幫助科學家選擇最合適的小鼠模型提供了參考。
這些生理數據總結可從各JAX小鼠的品系詳情頁面“疾病和表型”標簽下獲取。
常用數據
體重
許多研究人員將體重作為小鼠健康狀況和總體狀況的基本指標，有時甚至將其作為選擇最適合其研究目的的小鼠品系的標準。
血液學概況
了解血液的細胞組成可以幫助研究人員評估動物的健康狀況。這些概況包括：
▲ 白細胞 (White Blood Cell, WBC) 計數
▲ 紅細胞 (Red Blood Cell, RBC) 計數
▲ 血紅蛋白濃度
▲ 血細胞比容
▲ 平均紅細胞體積 (Mean Cell Volume, MCV)
▲ 平均細胞血紅蛋白濃度 (Mean Cell Hemoglobin Concentration, MCHC)
▲ 血小板計數
▲ 平均血小板體積 (Mean Platelet Volume, MPV)
▲ 網織紅細胞計數
▲ 網織紅細胞百分比
▲ 網織紅細胞血紅蛋白含量
▲ 中性粒細胞、淋巴細胞、單核細胞、嗜酸性粒細胞和嗜堿性粒細胞計數
▲ 中性粒細胞、淋巴細胞、單核細胞、嗜酸性粒細胞和嗜堿性粒細胞百分比
血清生化指標
許多科學家使用血清生化指標作為主要的健康指標，并研究常見的疾病狀態。血清生化指標數據包括：
▲ 白蛋白和總蛋白水平
▲ 血液尿素氮 (Blood Urea Nitrogen, BUN)
▲ 電解質（鈣、磷）
▲ 脂質水平（包括膽固醇、高密度脂蛋白膽固醇 (High Density Lipoprotein Cholesterol, HDLC)、甘油三酯和游離脂肪酸）
▲ 葡萄糖（飽腹）
▲ 丙氨酸轉氨酶 (Alanine Transferase, ALT)，
▲ 肌酸激酶 (Creatine Kinase, CK)
▲ 甲狀腺素 (T4)
器官重量
▲ 腦
▲ 心臟
▲ 肝臟
▲ 腎臟
▲ 脾臟
▲ 其他
身體構成（DEXA分析）
▲ 骨骼礦物質密度
▲ 骨無機鹽含量
▲ 瘦肉組織
▲ 脂肪組織
免疫學特征（通過流式細胞術進行脾臟分析）
▲ 淋巴樣細胞百分比（包括B 胞、T細胞、NK細胞和NKT細胞）
▲ 骨髓細胞百分比（粒細胞和單核細胞）
您可以利用這些基線數據選擇合適的近交系、優化實驗設計、減少不必要的預實驗，從而讓研究更加高效。
將不同品系進行比較
不僅如此，MPD還提供一些工具來幫助您比較不同品系的數據。例如，如果您要測量特定因素誘導后出現的發熱情況，您可能需要使用基線體溫較低的品系。而在下圖的比較數據中，您可以快速發現C3H/HeJ或BALB/cJ可能是不錯的選擇。
上傳您的數據
MPD另一個有趣的功能是，您可以上傳自己的數據并將其與已發表的數據并行比較，還可以將結果導出到工作表中。例如，如果您正在測量特定品系對高脂飲食或特定感染的反應，您可以下載各個相關數據并直接將其與您的數據進行初步比較。
無論您想知道您的小鼠愛吃甜食還是酗酒，在MPD中都可以找到基線數據。
如果您還在苦苦糾結如何選擇品系、預實驗能不能省去，如何簡化實驗降低預算這些問題，快來MPD研究一下已有的數據吧！
