科研一直以來都是燒錢的活動,我想很多同學對此肯定深有體會。
以前我們老板買試劑
我買試劑
作為科研萌新,有時不僅得說服老板購買外包服務,同時還得與公司代理協商,真的是太難了。
比如說,我們要購買一個基因敲除細胞模型,公司提供了價格較低的雜合子與價格較高的純合子,我們該如何選擇?
純合子與雜合子的區別
本著務實求真的科研精神,我們是不是需要先了解下純合子與雜合子的區別?
圖片來源:https://biologydictionary.net/homozygous/
在人和小鼠等二倍體生物的細胞中存在兩個染色體組,在兩個同源染色體相同位置出現的基因我們稱之為等位基因。當這兩個等位基因完全相同時,我們就說這個細胞是純合子,而當兩個等位基因不同時,這個細胞就是雜合子。也就是說,同一個細胞,在某對等位基因上是純合子,在另一對等位基因上也可以是雜合子。
具體到基因敲除的模型構建上來說,單個基因的敲除,涉及到一對等位基因的敲除,和單個等位基因的敲除。自然而然的,敲除一對等位基因就比敲除單個等位基因的效率要低,因此工作量也就大很多,也就造成很多公司報價上的差異。
作為生命科學未來的“包工頭”,以后分分鐘要管理上千萬的項目資金,我們肯定得科學地省錢,破除封建迷信,當然土豪隨意。
純合子、雜合子該如何選擇
在利用功能缺失策略對基因進行研究時,也就是基因敲除啦,一般情況下我們都是需要純合子敲除細胞系的(除非純合致死)。這時候,我們要記住一點,在設計實驗的過程中需要結合我們的實驗目的和下游檢測手段,最終設計出合理的上游實驗。也就說,對于基因敲除的下游驗證,一般是Western Blot和免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)。在Western Blot的驗證中,野生型和雜合子相比,理論上目的基因的表達量只是減少一半,甚至有些時候因為遺傳補償效應目的基因的表達量減少不了一半。毫無夸張地說,雜合子的敲除細胞系還不如做個敲低穩定細胞系來得靠譜。因此,對于敲除細胞系,還是花點精力或費點經費整純合子會靠譜點。
而在某些情況下,我們并不要求純合子,雜合子細胞模型就能出色解決問題了。比如,我們一位同學想要研究目的蛋白在胚胎干細胞分化過程中的動態,這時就涉及到了蛋白體內動態模型的模擬和構建。由于是個動態過程,細胞需要進行分化,而且目的蛋白的調控方式不能被改變,因此只能通過KI(knock in)的方法在目的基因的終止密碼子前插入熒光蛋白標簽,而后續涉及到的是活細胞成像技術。在這種情況下,目的蛋白不需要做到蛋白定量,因此也就不需要要求純合子。
就是醬紫,可以說無論是站在科研投入還是實驗可行性的層面,實驗思路和實驗設計將是決定研究是否能順利進行的關鍵部分。在當前各種實驗均可外包的科研環境下,小編認為科研人員更應該在實驗思路和課題方向預測的層面下功夫。同時,賽業生物為了更好地助力科研,我們擁有專業的技術支持團隊和研發團隊,從實驗思路的探討到實驗服務的定制交付,我們均能提供專業的技術支持和服務支持。如有需要,歡迎聯系我們咨詢。
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