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腫瘤基因功能研究思路解析

瀏覽次數:1771 發布日期:2021-3-2  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
  

 

國自然熱點是近幾年國自然申請的風向標,結合國自然熱點為課題方向,能有效提高國自然申請的中標率。腫瘤學是醫學科學研究中最為活躍的領域之一,隨著細胞生物學、發育生物學、遺傳學、免疫學等迅速發展,科學研究范式的改變以及多學科的交叉融合,腫瘤學基礎研究取得了一定進展,腫瘤學科申請項目數量及質量也逐漸提高。

 

腫瘤基因功能研究思路

雖然腫瘤研究的細分領域眾多,但不同的領域均會涉及很多基因功能的研究,例如與腫瘤發生、發展、轉移、耐藥分子機制相關的致癌基因、抑癌基因、轉移相關基因和耐藥相關基因等。腫瘤基因功能的研究是一個整體性的過程,從開始的基因篩選、到細胞水平(體外)和動物水平(體內)的功能性驗證,再到機制探討及驗證,形成一個完整的研究邏輯。

 

☑ 基因篩選:通常采用組學的方法進行分析,根據研究目標的不同,可分為基因組、轉錄組、蛋白組和代謝組分析。

 

☑ 細胞水平功能性驗證:細胞水平的調控則需要建立基因表達調控的細胞模型,如通過病毒載體或電轉等方式,實現對目標基因的過表達、敲低表達、敲除表達和點突變等。

 

☑ 動物水平功能性驗證:腫瘤研究最常用的動物模型則為免疫缺陷小鼠,如最基礎也是最常用的裸鼠,可通過移植腫瘤細胞建立CDX模型,對于重度聯合免疫缺陷小鼠則可用于建立PDX模型或人源免疫系統的重建,此外還有各種定制化的基因修飾動物也應用于腫瘤的研究中。

 

☑ 機制探討和驗證:而對于腫瘤機制的研究則各有不同,常規的思路是尋找目標基因上下游的調控分子或信號通路,并采用蛋白與DNA、RNA與蛋白、蛋白與蛋白等相互作用進行驗證。

圖1. 腫瘤基因功能研究思路

 

研究案例解析

精選案例一:DUSP1 inhibits cell proliferation, metastasis and invasion and angiogenesis in gallbladder cancer

研究目的:研究DUSP1在膽囊癌進程中的作用機制。

技術路線:對膽囊癌患者腫瘤細胞的DUSP1水平定量檢測→建立兩種GBC細胞系的DUSP1過表達細胞模型→細胞增殖/細胞遷移侵襲能力檢測→建立GBC-SD細胞的DUSP1敲除細胞模型→建立小鼠CDX模型檢測DUSP1在GBS細胞株過表達對腫瘤增殖的影響→檢測細胞凋亡情況→DUSP在膽囊癌中的作用機制。

結論:DUSP1可通過抑制血管形成因子的表達抑制腫瘤細胞的增殖侵襲。

圖2. DUSP1在膽囊癌進程中的作用機制

 

精選案例二:GREM1 overexpression inhibits proliferation, migration and angiogenesis of osteosarcoma

研究目的:研究GREM1基因在骨肉瘤中的相關功能。

研究技術路線:檢測5種骨肉瘤細胞系中的GREM1表達水平→檢測患者原代腫瘤組織中的GREM1及管家基因的表達水平→構建GREM1的U2OS穩轉細胞株→細胞增殖、侵襲、凋亡檢測及細胞周期檢測→構建干擾細胞模型→細胞增殖、侵襲、凋亡檢測及細胞周期檢測→裸鼠CDX模型→GREM1在骨肉瘤中的作用機制。

結論:GREM1可通過調節基質降解酶的表達來影響BMP的調節過程,GREM1過表達可抑制腫瘤細胞增殖侵襲,并促進凋亡。

圖3. GREM1基因在骨肉瘤中的相關功能

 

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腫瘤研究領域客戶引用文章精選:

1. Yuan H, Han Y, Wang X, et al. SETD2 restricts prostate cancer metastasis by integrating EZH2 and AMPK signaling pathways[J]. Cancer Cell, 2020, 38(3): 350-365.

2. Zhang F, Li R, Yang Y, et al. Specific decrease in B-cell-derived extracellular vesicles enhances post-chemotherapeutic CD8+ T cell responses[J]. Immunity, 2019, 50(3): 738-750.

3. Zhou X A, Zhou J, Zhao L, et al. KLHL22 maintains PD-1 homeostasis and prevents excessive T cell suppression[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2020, 117(45): 28239-28250.

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