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瓊脂糖凝膠電泳DNA回收實驗方法和注意事項

瀏覽次數:17254 發布日期:2018-5-23  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

實驗前準備及重要注意事項

1.第一次使用前應按照試劑瓶標簽的說明在Buffer PW中加入無水乙醇。
2.使用前請檢查Buffer PG,如果出現結晶或者沉淀,可在37℃水浴中放置3-5分鐘,即可恢復澄清。
3.電泳時最好使用新的電泳緩沖液,避免影響電泳和回收效果;如下一步實驗要求較高,請盡量使用TAE電泳緩沖液。
4.切膠時,紫外照射時間應盡量短,以免對DNA造成損傷。
5.回收率與初始DNA量和洗脫體積有關,初始量越少,洗脫體積越少,回收率越低。
6.將水浴鍋預熱至50℃。
7.Buffer PG中含有pH指示劑,當pH≤7.5時溶液的顏色為黃色,此時DNA才能夠有效的與膜結合,當pH值偏高時溶液的顏色變為桔紅色和紫色,需要進行調整。
8.所有離心步驟均可室溫下
 
操作步驟
 1.將單一目的DNA條帶從瓊脂糖凝膠中切下(盡量切除多余部分),放入干凈的離心管(自備)中,稱量計算凝膠重量(提前記錄離心管重量)。注意:若膠塊的體積過大,可將膠塊切成碎塊。
 2.向膠塊中加入1倍體積Buffer PG(如凝膠重為100 mg,其體積可視為100 μl,依此類推)。
 3.50℃水浴溫育,其間每隔2-3分鐘溫和地上下顛倒離心管,待溶膠液為黃色,以確保膠塊充分溶解。如果還有未溶的膠塊,可再補加一些溶膠液或繼續放置幾分鐘直至膠塊完全溶解。
 
注意:
1)凝膠完全融解后膠溶液為黃色,可進行后續操作;若膠溶液為桔紅色或紫色,可向膠溶液中加10-30 μl 的3 M醋酸鈉(pH 5.0),將溶液的顏色調為黃色后再進行后續操作。
2)膠塊完全溶解后最好將膠溶液溫度降至室溫再上柱,吸附柱在較高溫度時結合DNA的能力較弱。
 
 4.(可選步驟)當回收片段<300 bp時,應加入1/2膠體積的異丙醇,上下顛倒 混勻(如凝膠重100 mg,則加入50 μl的異丙醇)。
 5.柱平衡:向已裝入收集管中的吸附柱(Spin Columns DM)中加入200 μl Buffer PS,13,000 rpm(~16,200×g)離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
 6.將步驟3或4所得溶液加入到已裝入收集管的吸附柱中,室溫放置2分鐘,13,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱放回收集管中。注意:吸附柱容積為750 μl,若樣品體積大于750 μl 可分批加入。
 7.向吸附柱中加入450 μl Buffer PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),13,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱放回收集管中。注意:如果純化的DNA用于鹽敏感的實驗(例如平末端連接或直接測序),建議加入Buffer PW
 靜置2-5分鐘再離心。
 8.重復步驟7。
 9.13,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續的酶促反應(酶切、PCR等)。10.將吸附柱放到一個新的1.5 ml離心管(自備)中,向吸附膜中間位置懸空滴加50 μl
 Buffer EB,室溫放置2分鐘。13,000 rpm離心1分鐘,收集DNA溶液。-20℃保.DNA。
 
注意:
 1)為了提高DNA的回收量,可將離心得到的溶液重新滴加到吸附柱中,室溫放置2分鐘,13,000 rpm離心1分鐘。
 2)洗脫體積不應小于30 μl,體積過少會影響回收效率。
 3)回收大于10 kb的DNA片段時,Buffer EB應在50℃水浴中預熱,可增加回收效率。
 備注:本試劑盒也適用于PCR產物的純化回收。在PCR反應液中加入等體積的BufferPG,充分混勻(對于回收小于150bp的小片段可將溶液的體積增加到3倍以提高回收率)接上述步驟5進行后續操作。
發布者:上海凌儀生物科技有限公司儀器部
聯系電話:021-56722636
E-mail:zhangym200488@163.com

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