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國自然之三——臨床疾病基礎研究課題設計:細胞模型及檢測指標

瀏覽次數:3658 發布日期:2016-11-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

上回我們說到,臨床基礎研究課題,創新點在基因時研究內容該如何設計。三大塊,臨床相關性(A-C),功能(A-D),機制(A-B)。從而驗證我們的假設“A基因通過調控B機制在C疾病中發揮D功能”。

遺留了一個問題,細胞模型(動物模型)和檢測指標如何選擇。機制的嚴謹性(深度)和熱度(機制細分方向)是課題研究水平的地方,上回都沒有說要單獨出來聊聊。獨獨把細胞模型和檢測指標拿出來了,為啥呢。因為這個是評估課題科學性的地方。

疾病研究歷史中,按照現在科學研究的要求,越細越好,一旦疾病臨床表現確定到是哪個器官組織出問題,我們就往器官組織里面去找原因了。器官組織的最小功能單位是細胞。那么就問,是什么細胞與正常細胞不一樣,從而導致器官組織有問題,最終出現臨床表現的。這里的不一樣就是病理改變,醫院里病理科和檢驗科天天做。(想把寶圖拿出來,擔心大家審美疲勞,就不拿了。不清楚的筒子,移步前文參考。)

在細胞層面,我們要考慮3個問題,1、誰。2、怎么與正常不同(病理改變-檢測指標)。3、我能做嗎(可行性)。前面兩個是科學性評估,后一個跟我們一輩子的科學生涯相關。

1、誰

挖一塊疾病組織,問,這里面是只有一類細胞,還是多類細胞呀。大家不要認為這個問題很幼稚。N多年前,不少科學家默認腫瘤是均一組織,現在大家知道了,腫瘤是異質性的。

我想,如果您能從第一篇國自然文章看到這一篇,那您的答案肯定是多類。那么再問一個問題,我的課題設計中是寫多類還是一類呢。

如果您的答案是寫多類,那么返回意見往往是,課題設計不聚集。因為我們在細胞上的實驗,是為了驗證我們研究的A基因或藥物,是否能夠在細胞上導致病理改變,或起到緩解病理改變的作用。同一個基因,在不同的細胞類型中,功能可能是不同的,機理也可能是不同的。現在的課題看的是深度,而不是廣度。現在的研究,一般都是聚集于一點,深挖。越深越好。

不知道是否有筒子反對這個觀點。因為,現在腫瘤治療領域,CART很熱門,CART研究如果您還是涉及一類細胞,就錯了。為啥呢。因為這類研究是研究免疫細胞對腫瘤細胞的殺傷作用,研究的是兩類細胞間的關系(免疫細胞其實不是一類細胞,做免疫細胞的必須明確是哪類免疫細胞)。研究細胞間關系的課題,關系涉及的細胞類型,都要設計進來。

前幾年,不少人栽跟頭的地方是,應該只放一類細胞,放了多類。這幾年,研究關系的課題多了,不少人設計中卻只放了一類細胞的設計。

大家設計課題時,問問自己,我研究的是A基因或藥物在一類細胞中的功能,還是細胞間關系中發揮功能。細胞模型是

2、怎么與正常不同(病理改變-檢測指標)

這個地方其實就是我們實驗的檢測指標了。我采用什么指標證明我研究的基因或藥物在病理細胞中發揮了與疾病相關的功能。

比如我做癲癇研究,癲癇的發病器官和組織是腦部腦組織。細胞是腦神經元。OK,我的設計是,“把我假設與癲癇相關的基因,在腦神經元中干擾或過表達后,檢測MTT生長曲線,流式檢測周期改變,流式檢測凋亡改變”。這個設計OK嗎,我們平時看文章,很多文章里面都在這么做。評估所設計的檢測指標是否OK,科學性評估的依據是,這些檢測指標是否為臨床上這類細胞的病理改變。也就是臨床病人的這類細胞是否發生這個改變。癲癇,病人的腦神經元與正常人腦神經元的不同之一是異常放電。異常放電,在細胞上,我們應該做的是電生理檢測。

這個點上,“實驗方法不合理”這類返回意見就是在說這個。“實驗方法缺乏新意”很多老師看到這個返回意見,認為是要設計點新的實驗。其實這個點是在說,您用的實驗,是現在大家都在做的嗎。用已經過時的方法也可以,但現在大家常用的方法您必須得有。

細胞模型和檢測指標,這個地方到底怎么評估,我們下回分解。

3、我能做嗎(可行性)

季博說,這個點跟我們一輩子的科研生涯相關。這不是嚇唬您。科研生涯中,拿課題經費很重要,但更重要的是,我把課題做出來了,發表了高分SCI文章,讓大家都認可我的科研能力,然后順利的拿到下一個課題,有經費了繼續研究。良性循環。

如果課題設計中,細胞很難操作,實驗很難養。一審專家都會去看申請人背景介紹,看發表過啥文章。如果發表的文章用過這個細胞,做過這些實驗。那么您完成本項目是有可行性的。(現在說,申請國自然必須要有好的SCI文章,這些文章其實就是來證明申請人有科研能力,能夠完成本項目研究。)

國自然標書模板中,必須介紹申請人曾經承擔過什么項目,結題什么情況。如果我拿到了,但細胞難搞,實驗難做,沒發什么好文章。哪,憑什么說服專家,現在申請的這個項目我會好好做,會出好成果呢。

一旦拿不到下一個課題經費,后續科研怎么做呢。除非您認識扎克伯格,不差錢。不過,可行性有問題的項目,哪怕再美好,估計他也不會投經費吧。

總結下,臨床疾病基礎研究課題設計第一步

1、確定臨床問題研究的細胞模型(動物模型)。

2、確定評估基因或藥物功能的檢測指標。

3、評估課題組可行性。

PS:希望和季博在學習、實驗上有更多交流的朋友們,可以關注吉凱基因微信并回復“季博”兩個字。


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