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GeoMx DSP技術(shù)助力下咽鱗狀細(xì)胞癌的腫瘤微環(huán)境研究

瀏覽次數(shù):591 發(fā)布日期:2025-1-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
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文章題目:空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示下咽鱗狀細(xì)胞癌的腫瘤微環(huán)境及SLCO2A1與腫瘤抑制的相關(guān)性


1 文章概況 

下咽鱗狀細(xì)胞癌(HSCC)是一種具有惡性特征和較差預(yù)后的頭頸部腫瘤。該項(xiàng)研究利用DSP技術(shù)首次對HSCC進(jìn)行了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。研究樣本包括來自四位患者的原位腫瘤組織、腫瘤周圍組織及淋巴轉(zhuǎn)移組織。通過分析所有ROI超過18,000個(gè)基因的表達(dá),發(fā)現(xiàn)腫瘤組織中的成纖維細(xì)胞可能參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展,淋巴轉(zhuǎn)移組織的免疫浸潤低于原位腫瘤。研究還揭示了與預(yù)后相關(guān)的基因表達(dá)差異,例如SLCO2A1在腫瘤和淋巴轉(zhuǎn)移組織中顯著下調(diào),并與免疫浸潤相關(guān),且其過表達(dá)可抑制Fadu細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,表明SLCO2A1可能是HSCC的腫瘤抑制基因,可作為診斷和治療的潛在靶點(diǎn)
 
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技術(shù)路線

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù) 

形態(tài)學(xué)標(biāo)記:PanCK(上皮細(xì)胞)、CD45(免疫細(xì)胞)、αSMA(成纖維細(xì)胞)和SYTO 13(核染色)。Panel:GeoMx® Whole Transcriptome Atlas
 
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DSP技術(shù):下咽癌、鄰近正常組織和淋巴轉(zhuǎn)移組織的空間分布圖

3 樣本信息 

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4 文章結(jié)論 


通過DSP技術(shù)分析4例HSCC患者的正常、腫瘤和淋巴組織中的上皮細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和免疫細(xì)胞的基因表達(dá)差異,揭示了與腫瘤發(fā)生和免疫微環(huán)境相關(guān)的關(guān)鍵基因變化。研究發(fā)現(xiàn),在腫瘤組織中,與正常組織相比,SLCO2A1在腫瘤上皮細(xì)胞和成纖維細(xì)胞中表達(dá)下調(diào),而該基因在頭頸鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)中與良好預(yù)后有關(guān)。此外,MPPED2在淋巴轉(zhuǎn)移組織的上皮細(xì)胞中上調(diào),而IGHM和FCRL2在淋巴轉(zhuǎn)移組織的免疫細(xì)胞中也顯示上調(diào)。功能富集和免疫浸潤分析進(jìn)一步支持了這些基因的功能特性。研究還通過qRT-PCR、免疫組化染色及基因表達(dá)生存分析驗(yàn)證了SLCO2A1在HSCC中的抑癌作用,表明其能夠抑制HSCC的增殖和轉(zhuǎn)移,并且與HNSCC中的免疫浸潤呈正相關(guān)。因此,文章得出SLCO2A1可能是HSCC的一種潛在抗癌靶點(diǎn)和良好的預(yù)后標(biāo)志物,提供了未來診斷和治療的新方向。

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主要結(jié)論圖

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