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案例解析:酶Suclg2通過(guò)抑制Lactb琥珀酰化維持樹(shù)突狀細(xì)胞的耐受性

瀏覽次數(shù):1238 發(fā)布日期:2023-7-7  來(lái)源:麥特繪普

代謝重編程在包括樹(shù)突狀細(xì)胞 (DCs) 在內(nèi)的免疫細(xì)胞的分化和功能中起著關(guān)鍵作用。調(diào)節(jié)性 DCs 可在脾基質(zhì)等局部組織壁龕中產(chǎn)生,是維持免疫耐受的基質(zhì)調(diào)控免疫應(yīng)答的重要組成部分。代謝酶和代謝物在調(diào)節(jié)細(xì)胞識(shí)別和功能中發(fā)揮重要作用,它們?cè)谫x予DC耐受性特性中的作用亟待解決:如代謝物是否通過(guò)調(diào)節(jié)非常規(guī)翻譯后修飾(如琥珀酰化)?及其如何選擇性參與該過(guò)程的代謝酶的功能來(lái)調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)性DC的功能?

2023年5月,海軍軍醫(yī)大學(xué)/中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/南開(kāi)大學(xué)曹雪濤院士、海軍軍醫(yī)大學(xué)劉娟教授及團(tuán)隊(duì)在免疫學(xué)專業(yè)期刊Journal of Autoimmunity(IF=12.8)發(fā)表題為“Metabolic enzyme Suclg2 maintains tolerogenicity of regulatory dendritic cells diffDCs by suppressing Lactb succinylation”的研究論文,結(jié)合代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),揭示了琥珀酸輔酶 A 連接酶亞基 β (Suclg2)是維持 diffDCs 免疫調(diào)節(jié)功能所必需的代謝酶,通過(guò)抑制Lactb的琥珀酰化,阻止NF-κB信號(hào)激活,下調(diào)Ccl5、Il12b等促炎細(xì)胞因子的表達(dá),將成熟DC的促炎狀態(tài)重編程為致耐受性表型,為 DCs 免疫和耐受代謝調(diào)節(jié)的機(jī)制提供了新見(jiàn)解。(麥特繪譜提供Q300全定量代謝組檢測(cè)服務(wù))

研究流程

取骨髓細(xì)胞培養(yǎng)6d,在培養(yǎng)的第七天用LPS刺激,抗體篩選出成熟的樹(shù)突狀細(xì)胞(maDCs),隨后與脾間質(zhì)細(xì)胞共同培養(yǎng)5-9d,誘導(dǎo)出耐受性樹(shù)突狀細(xì)胞(diffDCs),進(jìn)行靶向代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析。

研究結(jié)果

 1. 調(diào)節(jié)型DC中琥珀酸水平降低,Suclg2表達(dá)增加

研究人員觀察到diffDCs表現(xiàn)出典型的耐受性表型和作為調(diào)節(jié)性DCs的功能,進(jìn)一步對(duì)maDCs和diffDCs進(jìn)行代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,結(jié)果顯示與maDCs相比,diffDCs分化期間天冬氨酸、丙氨酸和谷氨酸代謝顯著改變,特別是L-丙氨酸、L-谷氨酸、L天冬氨酸和琥珀酸在diffDC-D5中濃度顯著上調(diào),但在diffDC-D9中下降至較低水平。此外,diffDCs中的N -乙酰- L-天冬氨酸顯著上調(diào),γ-氨基丁酸顯著下調(diào)。隨后對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行代謝途徑富集分析,發(fā)現(xiàn)碳代謝是diffDCs中顯著上調(diào)的前3個(gè)代謝途徑之一,而在與碳代謝途徑相關(guān)的20個(gè)代謝酶基因中,Suclg2是其中上調(diào)最多的代謝酶。這些結(jié)果表明,diffDCs表現(xiàn)出以琥珀酸減少為特征的代謝改變,并且GFP特異性琥珀酸-輔酶A連接酶Suclg2在diffDCs中增加。

圖1. diffDC中Suclg2表達(dá)增加的同時(shí)琥珀酸水平降低

2. Suclg2的作用機(jī)制

Suclg2沉默可以將diffDC中共刺激分子CD40的受抑制表達(dá)恢復(fù)到與maDC類似的表達(dá)水平,而不影響maDC在表型水平上的成熟。并且Suclg2在支持線粒體功能和穩(wěn)定狀態(tài)下的呼吸的同時(shí),阻止炎性狀態(tài)下的糖酵解活化。進(jìn)一步表明了Suclg2對(duì)于維持diffDC的耐受性至關(guān)重要。

Suclg2沉默實(shí)驗(yàn)也揭示了Suclg2可以阻止diffDC中NF-κB信號(hào)通路的激活。此前研究顯示Suclg2催化琥珀酸和琥珀酰輔酶A的可逆轉(zhuǎn)化,可以通過(guò)將琥珀酰輔酶A轉(zhuǎn)移至賴氨酸殘基而通過(guò)琥珀酰化來(lái)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能。本研究通過(guò)同源染色體組合構(gòu)建Suclg2fl/-  Itgax-Cre+和對(duì)照組Suclg2fl/-  Itgax-Cre小鼠來(lái)研究琥珀酰化和suclg2的免疫作用,揭示了Suclg2可能通過(guò)抑制潛在蛋白靶點(diǎn)的賴氨酸琥珀酰化來(lái)阻止diffDC中NF-κB的激活。

3. Suclg2抑制Lactb蛋白琥珀酰化 

進(jìn)一步鑒定琥珀酰化的蛋白質(zhì)和特定的賴氨酸殘基,研究人員利用琥珀酰化修飾組學(xué)技術(shù),對(duì)用或不用琥珀酸二乙酯處理,及SucIg2或模擬過(guò)表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的HEK293T細(xì)胞進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)高濃度的琥珀酸可以導(dǎo)致琥珀酰化豐度增加,同時(shí),Suclg2過(guò)表達(dá)下調(diào)了一系列蛋白的琥珀酰化。KEGG通路富集結(jié)果顯示,高濃度琥珀酸酯作用下,被Suclg2顯著抑制賴氨酸琥珀酰化的蛋白與Hippo信號(hào)通路、中心碳代謝和細(xì)胞凋亡相關(guān)。值得注意的是,線粒體蛋白內(nèi)酰胺酶β (Lactb)的賴氨酸殘基K252、K283和K284被顯著琥珀化。進(jìn)一步驗(yàn)證了在高琥珀酸水平下,Lactb是其琥珀酰化被Suclg2抑制的靶蛋白。

最后,研究人員證明了Lactb在調(diào)節(jié)NF-κB信號(hào)通路中的積極作用,即Suclg2可能通過(guò)抑制Lactb琥珀酰化來(lái)阻止炎癥狀態(tài)并維持調(diào)節(jié)性DC的耐受性功能。有趣的是,LPS刺激后,Lactb的mRNA水平迅速下降。因此,LPS下調(diào)Lactb可能是抑制NF-κB信號(hào)過(guò)度激活的一種內(nèi)部負(fù)調(diào)控方式,其具體機(jī)制尚待進(jìn)一步研究。

圖2. 高濃度琥珀酸作用下Suclg2抑制Lactb賴氨酸琥珀酰化

小結(jié)

綜上所述,調(diào)節(jié)性DC在基質(zhì)驅(qū)動(dòng)分化過(guò)程中,代謝酶Suclg2顯著上調(diào),抑制Lactb琥珀酰化,從而阻止NF-κB信號(hào)通路的激活,下調(diào)促炎細(xì)胞因子如Ccl5、Il12b的表達(dá),從而共同維持調(diào)節(jié)性DC的耐受性功能。本研究為加強(qiáng)調(diào)節(jié)性DC的耐受性提供了新的線索,這可能有助于開(kāi)發(fā)基于DCs的抗炎癥或自身免疫性疾病的治療策略。

原文文獻(xiàn)

Xiaomin Zhang, et al. Metabolic enzyme Suclg2 maintains tolerogenicity of regulatory dendritic cells diffDCs by suppressing Lactb succinylation. Journal of Autoimmunity. 2023.

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繪譜幫你測(cè)

麥特繪譜為上述研究提供Q300全定量代謝組檢測(cè)分析,準(zhǔn)確識(shí)別出diffDCs表現(xiàn)出以琥珀酸減少為特征的代謝改變。本公司深耕靶向定量代謝組學(xué)領(lǐng)域多年,我們?nèi)蚴讋?chuàng)的同位素內(nèi)標(biāo)定量Q300全定量代謝組技術(shù)經(jīng)過(guò)10萬(wàn)例+樣本的驗(yàn)證,已成為深入挖掘功能機(jī)制和臨床轉(zhuǎn)化產(chǎn)品開(kāi)發(fā)的基石,獲得業(yè)內(nèi)專家學(xué)者們的高度認(rèn)可。截至2023年6月,Q300技術(shù)已協(xié)助客戶發(fā)表70余篇SCI文章,平均IF>10,成果涵蓋腫瘤/癌癥、代謝性疾病、免疫疾病、神經(jīng)系統(tǒng)性疾病、衰老、環(huán)境毒理學(xué)、中醫(yī)中藥等研究領(lǐng)域。在對(duì)Q300技術(shù)不斷夯實(shí)提升的過(guò)程中,我們研發(fā)出Q500,Q1000等全定量代謝組方法,高通量檢測(cè)、覆蓋的功能性代謝物和代謝通路更加豐富全面。

麥特繪譜專注于代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)疾病研究領(lǐng)域,擁有成熟的代謝組學(xué)檢測(cè)平臺(tái),以全定量靶向代謝組學(xué)技術(shù)為核心,包括全球獨(dú)有技術(shù)Q1000,Q500、Q300、Q200和各類小分子代謝物單獨(dú)檢測(cè)方法共20+系列,兼顧非靶向代謝組學(xué)和代謝流技術(shù)。同時(shí)還有菌群16S測(cè)序、宏基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等多組學(xué)及聯(lián)合分析等全套解決方案。獨(dú)家的檢測(cè)技術(shù)、全面的數(shù)據(jù)報(bào)告及專業(yè)科研級(jí)別的售后探討,助您科研探索之路不斷創(chuàng)新和突破。歡迎聯(lián)系獲取詳細(xì)資料!

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