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國自然之三——臨床疾病基礎(chǔ)研究課題設(shè)計:細胞模型及檢測指標

瀏覽次數(shù):3651 發(fā)布日期:2016-11-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

上回我們說到,臨床基礎(chǔ)研究課題,創(chuàng)新點在基因時研究內(nèi)容該如何設(shè)計。三大塊,臨床相關(guān)性(A-C),功能(A-D),機制(A-B)。從而驗證我們的假設(shè)“A基因通過調(diào)控B機制在C疾病中發(fā)揮D功能”。

遺留了一個問題,細胞模型(動物模型)和檢測指標如何選擇。機制的嚴謹性(深度)和熱度(機制細分方向)是課題研究水平的地方,上回都沒有說要單獨出來聊聊。獨獨把細胞模型和檢測指標拿出來了,為啥呢。因為這個是評估課題科學(xué)性的地方。

疾病研究歷史中,按照現(xiàn)在科學(xué)研究的要求,越細越好,一旦疾病臨床表現(xiàn)確定到是哪個器官組織出問題,我們就往器官組織里面去找原因了。器官組織的最小功能單位是細胞。那么就問,是什么細胞與正常細胞不一樣,從而導(dǎo)致器官組織有問題,最終出現(xiàn)臨床表現(xiàn)的。這里的不一樣就是病理改變,醫(yī)院里病理科和檢驗科天天做。(想把寶圖拿出來,擔(dān)心大家審美疲勞,就不拿了。不清楚的筒子,移步前文參考。)

在細胞層面,我們要考慮3個問題,1、誰。2、怎么與正常不同(病理改變-檢測指標)。3、我能做嗎(可行性)。前面兩個是科學(xué)性評估,后一個跟我們一輩子的科學(xué)生涯相關(guān)。

1、誰

挖一塊疾病組織,問,這里面是只有一類細胞,還是多類細胞呀。大家不要認為這個問題很幼稚。N多年前,不少科學(xué)家默認腫瘤是均一組織,現(xiàn)在大家知道了,腫瘤是異質(zhì)性的。

我想,如果您能從第一篇國自然文章看到這一篇,那您的答案肯定是多類。那么再問一個問題,我的課題設(shè)計中是寫多類還是一類呢。

如果您的答案是寫多類,那么返回意見往往是,課題設(shè)計不聚集。因為我們在細胞上的實驗,是為了驗證我們研究的A基因或藥物,是否能夠在細胞上導(dǎo)致病理改變,或起到緩解病理改變的作用。同一個基因,在不同的細胞類型中,功能可能是不同的,機理也可能是不同的。現(xiàn)在的課題看的是深度,而不是廣度。現(xiàn)在的研究,一般都是聚集于一點,深挖。越深越好。

不知道是否有筒子反對這個觀點。因為,現(xiàn)在腫瘤治療領(lǐng)域,CART很熱門,CART研究如果您還是涉及一類細胞,就錯了。為啥呢。因為這類研究是研究免疫細胞對腫瘤細胞的殺傷作用,研究的是兩類細胞間的關(guān)系(免疫細胞其實不是一類細胞,做免疫細胞的必須明確是哪類免疫細胞)。研究細胞間關(guān)系的課題,關(guān)系涉及的細胞類型,都要設(shè)計進來。

前幾年,不少人栽跟頭的地方是,應(yīng)該只放一類細胞,放了多類。這幾年,研究關(guān)系的課題多了,不少人設(shè)計中卻只放了一類細胞的設(shè)計。

大家設(shè)計課題時,問問自己,我研究的是A基因或藥物在一類細胞中的功能,還是細胞間關(guān)系中發(fā)揮功能。細胞模型是

2、怎么與正常不同(病理改變-檢測指標)

這個地方其實就是我們實驗的檢測指標了。我采用什么指標證明我研究的基因或藥物在病理細胞中發(fā)揮了與疾病相關(guān)的功能。

比如我做癲癇研究,癲癇的發(fā)病器官和組織是腦部腦組織。細胞是腦神經(jīng)元。OK,我的設(shè)計是,“把我假設(shè)與癲癇相關(guān)的基因,在腦神經(jīng)元中干擾或過表達后,檢測MTT生長曲線,流式檢測周期改變,流式檢測凋亡改變”。這個設(shè)計OK嗎,我們平時看文章,很多文章里面都在這么做。評估所設(shè)計的檢測指標是否OK,科學(xué)性評估的依據(jù)是,這些檢測指標是否為臨床上這類細胞的病理改變。也就是臨床病人的這類細胞是否發(fā)生這個改變。癲癇,病人的腦神經(jīng)元與正常人腦神經(jīng)元的不同之一是異常放電。異常放電,在細胞上,我們應(yīng)該做的是電生理檢測。

這個點上,“實驗方法不合理”這類返回意見就是在說這個。“實驗方法缺乏新意”很多老師看到這個返回意見,認為是要設(shè)計點新的實驗。其實這個點是在說,您用的實驗,是現(xiàn)在大家都在做的嗎。用已經(jīng)過時的方法也可以,但現(xiàn)在大家常用的方法您必須得有。

細胞模型和檢測指標,這個地方到底怎么評估,我們下回分解。

3、我能做嗎(可行性)

季博說,這個點跟我們一輩子的科研生涯相關(guān)。這不是嚇唬您。科研生涯中,拿課題經(jīng)費很重要,但更重要的是,我把課題做出來了,發(fā)表了高分SCI文章,讓大家都認可我的科研能力,然后順利的拿到下一個課題,有經(jīng)費了繼續(xù)研究。良性循環(huán)。

如果課題設(shè)計中,細胞很難操作,實驗很難養(yǎng)。一審專家都會去看申請人背景介紹,看發(fā)表過啥文章。如果發(fā)表的文章用過這個細胞,做過這些實驗。那么您完成本項目是有可行性的。(現(xiàn)在說,申請國自然必須要有好的SCI文章,這些文章其實就是來證明申請人有科研能力,能夠完成本項目研究。)

國自然標書模板中,必須介紹申請人曾經(jīng)承擔(dān)過什么項目,結(jié)題什么情況。如果我拿到了,但細胞難搞,實驗難做,沒發(fā)什么好文章。哪,憑什么說服專家,現(xiàn)在申請的這個項目我會好好做,會出好成果呢。

一旦拿不到下一個課題經(jīng)費,后續(xù)科研怎么做呢。除非您認識扎克伯格,不差錢。不過,可行性有問題的項目,哪怕再美好,估計他也不會投經(jīng)費吧。

總結(jié)下,臨床疾病基礎(chǔ)研究課題設(shè)計第一步

1、確定臨床問題研究的細胞模型(動物模型)。

2、確定評估基因或藥物功能的檢測指標。

3、評估課題組可行性。

PS:希望和季博在學(xué)習(xí)、實驗上有更多交流的朋友們,可以關(guān)注吉凱基因微信并回復(fù)“季博”兩個字。


長按加關(guān)注

發(fā)布者:上海吉凱基因醫(yī)學(xué)科技股份有限公司
聯(lián)系電話:400-621-0302
E-mail:marketing@genechem.com.cn

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