DNA甲基化在基因表達(dá)調(diào)控中扮演著重要的角色(人類的甲基化只發(fā)生在CpG位點,大多數(shù)CpG島位于啟動子和第一外顯子區(qū)域,啟動子區(qū)域的甲基化抑制基因的表達(dá)),在正常的細(xì)胞發(fā)育和維持組織穩(wěn)定性方面有著重要的作用機制。人類的許多疾病(包括癌癥)都是由于異常的甲基化引起的。應(yīng)用芯片這個高通量手段檢測基因組的甲基化,會大大加速甲基化研究發(fā)展,提升研究效率,并很有可能發(fā)展成人類疾病診斷、預(yù)防和治療的有效工具,為此Illumina推出Illumina DNA甲基化芯片。
芯片名稱:Illumina Infinium Human Methylation450 BeadChip
芯片信息:每張芯片可平行進(jìn)行12個樣本的檢測,包含了450,000多個甲基化位點,全面覆蓋了96%的CpG島,并根據(jù)需求加入了CpG島以外的CpG位點、人類干細(xì)胞非CpG甲基化位點、正常組織與腫瘤(多種癌癥)組織差異甲基化位點、編碼區(qū)以外的CpG島、miRNA啟動子區(qū)域和已通過GWAS的疾病相關(guān)區(qū)域的位點,同時覆蓋了Human Methylation27 BeadChip的90%的位點。是唯一一款適合表觀基因組全關(guān)聯(lián)分析研究的全基因組DNA甲基化芯片。
技術(shù)路線
生物信息學(xué)分析
樣品要求
1)樣品類型:細(xì)胞、新鮮組織或DNA樣品。
2)樣品量:細(xì)胞樣品請?zhí)峁┲辽?×106個細(xì)胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片。DNA樣品請?zhí)峁?μg以上的基因組DNA。
3)樣品質(zhì)量:DNA無明顯降解,OD260/280值在1.7~1.9之間,濃度≥ 50ng/μl。
4)樣品保存:細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)用液氮速凍后,-80℃保存。DNA樣品可溶于的超純水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃長期保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
5)樣品運輸:細(xì)胞或組織樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。DNA樣本放離心管或者PCR板中,密封后,冰袋運輸。
參考文獻(xiàn)
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晶能生物技術(shù)(上海)有限公司(簡稱“晶能生物”)成立于2010年2月。自成立以來,高速發(fā)展,成為中國生物技術(shù)服務(wù)行業(yè)領(lǐng)先地位的公司。
晶能生物專注健康醫(yī)療產(chǎn)品和生命科學(xué)領(lǐng)域科技服務(wù),抓住了中國健康醫(yī)療產(chǎn)業(yè)的巨大機遇和生命科學(xué)市場的快速成長勢頭,形成了以產(chǎn)品研發(fā)和科技服務(wù)為核心,涉足生命科學(xué),臨床疾病、人類健康等領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化服務(wù)體系,在產(chǎn)品研發(fā)、人才建設(shè)、市場營銷、銷售渠道、專業(yè)服務(wù)等方面形成極具競爭優(yōu)勢的中國知名的高新技術(shù)企業(yè)。
晶能生物注重產(chǎn)品開發(fā),成立創(chuàng)新健康醫(yī)療研究中心,資深的專家團(tuán)隊、國際先進(jìn)的儀器設(shè)備,完善的管理和研發(fā)體系,讓中心成為一個充滿激情、力量雄厚、極具發(fā)展?jié)摿Φ难邪l(fā)機構(gòu)。
晶能生物通過ISO9001:2008質(zhì)量體系認(rèn)證, 并率先成為illumine CsPro和BioNano官方認(rèn)證服務(wù)商。主要技術(shù)平臺有BioNano單分子光學(xué)圖譜平臺、Illumina-Hiseq3000高通量測序平臺、Illumina-Hiseq2500高通量測序平臺、Illumina-Hiseq1500高通量測序平臺、Illumina-Miseq高通量測序平臺,Illumina-iScan基因芯片平臺、Illumina-ECO Real Time PCR平臺、Sequenome-質(zhì)譜分析平臺、曙光高性能服務(wù)器平臺以及各種配套設(shè)備,完成項目達(dá)到近2000個,完成專利達(dá)到近10項,合作客戶發(fā)表文章影響因子超過400。晶能生物已取得國內(nèi)二代測序,基因芯片等市場的競爭優(yōu)勢,成為這個行業(yè)的領(lǐng)先者。
晶能生物奉行客戶第一、共享快樂、共同成長、持續(xù)發(fā)展的原則,始終懷著感恩的心態(tài),努力做一個讓社會、客戶、員工和股東滿意的企業(yè),并成為提供健康醫(yī)療產(chǎn)品和科技服務(wù)的領(lǐng)導(dǎo)性公司。