微衛(wèi)星標(biāo)記(Microsatellite)也稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)或簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復(fù)序列。微衛(wèi)星位點(diǎn)通常通過(guò)PCR擴(kuò)增和電泳檢測(cè),并根據(jù)片段大小分離等位基因進(jìn)行分析;擴(kuò)增后的等位微衛(wèi)星可以用多種方法檢測(cè),1)傳統(tǒng)方法采用聚丙烯酰胺凝膠電泳銀染的方法適用于前期批量引物篩選;2)利用ABI遺傳分析儀對(duì)熒光標(biāo)記的DNA片段進(jìn)行檢測(cè),結(jié)合分子量?jī)?nèi)標(biāo)進(jìn)行DNA片段長(zhǎng)度計(jì)算,使STR分型變得高效快捷,適合大量樣本的檢測(cè)。
1) SSR/STR分型分析
前期確認(rèn)階段:試驗(yàn)樣本類型,數(shù)量,引物,簽訂試驗(yàn)合作合同;
試驗(yàn)階段:DNA提取,PCR擴(kuò)增,瓊脂糖電泳檢測(cè),PAGE篩選批量擴(kuò)增引物和可以進(jìn)行混合檢測(cè)的引物,批量PCR,ABI3700xl批量檢測(cè)(內(nèi)標(biāo)為ROX500,Liz-500)
數(shù)據(jù)分析:和客戶詳細(xì)溝通,確認(rèn)分析方案。品種分析,或群體分析。讀取01矩陣or片段大小;聚類分析;多樣性分析;多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(
AP) 、多態(tài)位點(diǎn)百分率
( P) 、平均等位基因數(shù)
(N a) 、有效等位基因數(shù)
(N e) 、Nei′s基因多樣性指數(shù)
(H) 、Shannon′s信息指數(shù)
( I) 、遺傳分化度
(Gst)等。利用NTSYS進(jìn)行聚類分析。
2)客戶須知:
本公司需要簽訂技術(shù)服務(wù)合作合同;
本公司再試驗(yàn)結(jié)束后,如沒要求,試驗(yàn)樣本將統(tǒng)一銷毀;
本公司不接受具有致病性和潛在危險(xiǎn)的原始樣本,此類樣本請(qǐng)您提供樣本DNA。
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北京博友順生物技術(shù)有限公司,經(jīng)過(guò)幾年的發(fā)展公司更專業(yè)于分子標(biāo)記技術(shù)服務(wù)。公司致力于:基因組SSR引物開發(fā)、AFLP檢測(cè)、SSR/STR技術(shù)服務(wù)、ISSR、MSAP、SNP基因分型、條形碼分析、克隆分子實(shí)驗(yàn)。本著“質(zhì)量第一,服務(wù)至上”的原則為各大院校、醫(yī)院、科研院所等單位,提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品和服務(wù),最大程度的滿足用戶的需要。
公司感謝廣大老師五年來(lái)對(duì)公司的厚愛和支持,將再接再厲為廣大老師做好科研后勤工作。我們非常慶幸能成長(zhǎng)在生物行業(yè)剛剛起航的年代里,能跟隨各位老師前輩們共進(jìn)步、共成功