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LabChipGX Touch核酸分析系統
LabChipGX Touch核酸分析系統
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產品詳情

LabChip® GX Touch 微流體技術簡化了平板電泳的諸多人工步驟,并提供對基因組研究,無論是 PCR 前還是 PCR 后的工作流程都至關重要的樣品完整性及其他各項全面質控。

采用便捷的觸摸屏界面,即使是臨時用戶都可很快上手,方便準備和運行樣品。

LabChip GX Touch 提供:
  • 觸屏點擊式快速樣品分析‒僅需 30 秒/樣品
  • 量化評價 RNA 和 DNA 樣品完整性,確保只有優質的樣品用于下游分析檢測
  • 最高批處理通量 24 個樣品的高效平臺節約時間和試劑用量;最高批處理通量 384 個樣品的型號則適用于高通量工作流程
  • 數據輸出選項:電泳峰圖、虛擬膠圖或數據表格形式
無論您的測序實驗室需要分析稀缺和珍貴樣品,還是運行 PCR-free的流程,亦或是需要對樣品中的每個片段定量以進行基因分型分析,方便易用、成本低、通量高且靈活的 LabChip GX Touch 系列可以極大地減輕分析日益增多的樣品的負擔。

LabChip GX 觸摸屏簡化了樣品的分析
Touch — 人性化操作
  • 加載樣品板和芯片
  • 選擇樣品(一次最多運行 384 個樣品)
  • 選擇實驗類型
  • 觸點“ 運行 ”,開始實驗
  • 您甚至可以讓系統自動將數據直接導出到您的網絡或 LIMS 系統(圖 2)

運行 — 實時觀察運行
  • 樣品分析耗時少至 30 秒
  • 數據采集過程中電泳峰圖實時可見
  • 在運行環境中將采集到的數據疊加比較樣品譜式
  • 挑選不同運行時間分析特征注釋

回顧 — 實時查看數據或導出以待日后分析
  • 選擇以電泳峰圖、虛擬膠圖或數據表格形式顯示(圖 3)
  • 使用 TIBCO Spotfire® 數據可視化軟件強化分析結果
  • 收集選擇多板樣品的數據進行平行分析比對
  • 挑選過濾具備關鍵屬性應用的數據
  • 突出顯示目標峰譜
 

圖3. 靈活的數據選項允許多種格式的實時查看或導出

 
LabChip GX Touch 軟件能夠通過少量設置來進行實驗。實驗設置參數文件可下載到儀器上,并通過觸摸按鍵執行。自動保留最近一次實驗運行的參數,以方便以相同的實驗參數繼續運行多批樣品。數據查看軟件模塊可幫助科學家從遠離實驗室的工作區查看已完成的樣品。軟件的使用許可證無數量限制,同事之間可共享數據,使得項目合作變得簡單而直接。LabChip GX Touch 數據文件可與 TIBCO Spotfire 兼容(可選功能)。


只將高質量的核酸樣品送到下游
電泳分析是二代測序文庫質控的重要環節,它可同時提供每個樣品的片段大小以及定量信息。LabChip GX Touch 自動完成 DNA 和 RNA 片段以及 smear 樣品的片段大小和濃度分析,用于測序的文庫樣品的質控。片段樣品分析通常用于交叉檢驗片段化或者 PCR 步驟的效果。文庫樣品的 DNA 總量分析均一化步驟。

節約樣品
減少分析時樣品的消耗,是很多實驗室考慮的重要因素。對于諸如染色體免疫共沉淀測序和 PCR-free 等方法制備的濃度非常低的文庫樣品,這一點至關重要。NGS 3K 試劑盒就是專為這類有特別高靈敏度要求的測序流程而開發的。LabChip 可以對濃度低至 2.5pg/μL的 smear 以及 0.5pg/μL 的片段進行準確定量,實現對稀缺和珍貴樣品的快速分析(圖 4)

 
圖4.上 圖 顯 示 了 DNA NGS 3K 檢測樣品的靈敏度。 同一 NGS 文庫樣品進行 6 次 3 倍系列稀釋,實
驗 結 果 展 示 了 LabChipDNA NGS 3K 檢測樣品濃度 下 限。數 據 結 果 在LabChip GX Touch 儀 器
上展示。
 
快速分析RNA
LabChip Touch 平臺提供了易于理解的 RNA 濃度以及核糖體 RNA 的比例,與 RNA 質量評分共同用作完整性評價指標(圖 5)。RNA 質量評分 (RQS) 是對樣品的質量和完整性的量化評價,可預測下游基因表達實驗(如芯片分析或實時 PCR 等)的成功幾率。

 
圖5. RNA 電泳圖譜,其中展示 18S 和 28S 峰
 
除 RQS 值外,分析軟件現在可以自動計算DV200 值。這兩個值可以導出,并用于確定來自諸如 FFPE 標本的RNA 樣品的質量。經驗證,RQS 與 Agilent® RIN(RNA完整性指數)密切相關并遵循相同的 0-10 量化評級。

基因組 DNA 樣品降解評分
為 LabChip GX Touch 系統開發的基因組 DNA 實驗創新性的引入了基因組 DNA 質量評分(GQS),替代傳統的凝膠電泳。所提供的電子數據,兼容實驗室信息管理系統、可以輕松歸檔和分發。可在 30 - 60 秒內快速分析 25 - 12000bp 的 DNA 樣品(對于 gDNA 完整性檢測上限可達 40000 bp)(圖 6)。

 
圖6.以電泳圖譜展示的基因組 DNA 質量評估
 
Small RNA 分析
LabChip® 小 RNA 試劑盒能夠快速分離和測定多種片段范圍在 20 至 150 核甘酸 (nt) 之間的小 RNA 樣品,包括 m i R N A 、 s i R N A 、 p i R N A 、 t R N A 以 及CRISPR-gRNA。這個全新的小 RNA 分析方法可快速自動分析小 RNA 片段大小和相對豐度從而可以達到節省時間和成本。LabChip® 微流控毛細管電泳技術能夠在一分鐘內自動分離和分 析小 RNA 樣品。系統軟件自動分析數據,通過采用內部參考品 和標準品來確定小RNA 樣品的片段大小和濃度(圖 7)。

 
圖7.LabChip®小RNA檢測方法可自動測定小RNA樣本的片段片段大小,具有很高的準確度和精密度。

Labchip 電泳
工作原理

LabChip 電泳在小型微流體芯片上進行(圖 8)。將芯片裝載入 LabChip GX Touch 系統后,芯片孔與鉑電極接觸,由鉑電極提供電壓和電流控制。系統機械臂將微孔板上的樣品孔直接移動到芯片的毛細管“ 吸管 ”下方,約 150 nL樣品被抽吸到芯片上。待分析樣品逐一被電泳分離,樣品條帶被激光誘導熒光檢測。通過 ladder 及內標確定各條帶的大小和濃度。
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