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客戶文章(Plant Com) DAP-seq助力揭示甘藍型油菜早花的遺傳機制

瀏覽次數:294 發布日期:2025-4-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
突破性發現!油菜BnaC3.LFY基因內含子變異調控開花時間,助力精準育種。DAP-seq和RNA-seq聯合分析雙劍合璧,結合SV-GWAS結果,從多個維度進行深度的數據挖掘,更全面、更深入地理解生命活動的奧秘。
2025年3月15日,浙江大學朱楊課題組在《Plant Communications》(IF=9.4)上發表了題目為“The Intronic Structure Variation of Rapeseed BnaC3.LEAFY Regulates the Timing of Inflorescence Formation and Flowering”的研究論文。該文章通過DAP-seq技術聯合RNA-seq,解析了甘藍型油菜BnaC3.LFY早花的遺傳機制,為甘藍型油菜早熟育種提供了基因資源和理論依據。
研究背景
甘藍型油菜(Brassica napus)作為全球第二大植物油來源,其花序形成和開花時間直接影響產量。盡管單核苷酸多態性(SNP)研究較多,但結構變異(SV)對農藝性狀的貢獻尚未充分探索。
研究結果
1、本研究通過對300份核心油菜種質的重測序分析,鑒定出42,384個高質量SV。為了識別與花序形成相關的SVs,作者進行了全基因組關聯研究(SV-GWAS)。結果顯示有7個遺傳位點以及11個相關的候選基因與早花序形成相關。并發現位于 BnaC3.LFY 基因第二內含子的LINE反轉錄轉座子插入(Hap1 單倍型)與油菜早花表型顯著相關。
2、為了進一步研究BnaC3.LFY調控機制,作者進行了DNA親和純化測序(DAP-seq) 鑒定出超過5萬個結合位點,覆蓋基因啟動子、內含子及遠端調控區。結合RNA-seq數據與CRISPR突變體分析,揭示了3種核心結合序列(如 WTTAHCCAWTGG、KACACACTGGAC 等),這些基序與擬南芥AtLFY的經典基序(CCANTGG)既保守又存在物種特異性分化。BnaC3.LFY通過直接調控72個基因(如開花整合因子、分生組織決定基因),形成劑量依賴的級聯調控網絡。
3、通過基因敲除和跨物種功能保守性驗證,進一步證實內含子調控功能在植物中具有進化保守性,為作物改良提供了普適性策略。
發布者:藍景科信河北生物科技有限公司
聯系電話:15632249798
E-mail:hope.liu@bluescape.cc

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