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ECO(BIOLOG Eco Board)生態板介紹及使用流程

瀏覽次數:2759 發布日期:2024-5-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
ECO生態板介紹
微生物群落可以提供有用的信息對于研究應用和基礎環境事件。
微生物存在于各種環境,對于環境中的化學和物理變化會首先做出反應。因它們位于食物鏈底層,微生物群落的變化常是環境整體健康和活力變化的開端。
 
BIOLOG ECO平板特別為群落分析和微生態研究設計的,在一批微生態學家要求下設計的較之GN平板有較多碳源重復的生態分析板。
首先是1991年J. Garland and A. Mills.1利用BIOLOG 微平板分析群落。研究者發現通過接種混合菌群到GN板,培養一段時間后測量群體的指紋圖譜,可以確定微生物群落的特征。這種
群落層面的生理圖譜分析方法在辨別空間和時間層面微生物群落變化是很有效的。在應用生態研究中,微平板既可以用來測試正常菌群的穩定性,也可以測定引入各種外界因素作用后微生物群落發生的變化。
 
在環境科學的各種領域作的研究顯示,BIOLOG 微平板在這方面有很多的應用。利用biolog微平板研究 群落變化已經應用于土壤,水,廢水,活性污泥,混合肥料和工業廢棄物領域。利用biolog 微平板分析微生物群落已發表超過500篇文章。
 
Ecoplate
Ecoplate 包含用于土壤群落分析最常用的31種碳源。這些碳源有3個平行,可以獲得更多的重復數據。微生物群落產生特征性的反應稱作代謝指紋圖譜。從單個的微平板上的指紋圖譜就可以提供大量的信息。
 
微平板培養2-5天后對群落反應圖譜進行分析,利用統計軟件比較分析圖譜的變化。常用PCA(主成分分析)軟件分析孔顏色產生均值(average well color development,AWCD ),但其他的統計方法也是可行的,或許也具有相應的優勢。2-7
圖譜的變化反應了群落隨時間發生的變化。
 
BIOLOG 微平板分析技術在研究群落和生態變化方面與脂肪酸分析方法作了比較。微平板對環境變化更靈敏。同時也發現對于一些主要決定元素如溫度和水更敏感。
 
對GN和GN2 微平板也作了類似的分析。對一些研究來說,最好還是選擇ECO平板。但主要還是取決于自己的研究來決定哪種板適合群落 或生態分析。
 
步驟
1 環境樣品 以水溶液 或懸浮做成懸濁液后(土壤,污泥,沉積物等)直接加入平板。
2 微平板在自己設定的時間段培養和分析
3 用以下特征評價分析群落水平的生理圖譜:
圖譜生成(相似度)
每孔的顏色變化率
孔反應的豐富度(多樣性)
 
當細胞利用孔中的碳源進行呼吸代謝。群落中的細胞進行呼吸代謝會還原包含在碳源中的四唑紫染料。
反應圖譜可以利用biolog 讀數儀來高效分析。也可以用普通酶標儀來讀取590nm處的OD值。統計分析數據常用其中的標準軟件套裝。也有研究者發現使用PCA比其他軟件更好些。獲得更詳細的信息。
  
碳源共分成6大類:
  • 碳水化合物類
B2,D-Xylose,D-木糖
  • 聚合物類,
A2,ß-Methyl-D-Glucoside,ß-甲基D-葡萄糖苷  , A3,D-Galactonic Acid y-Lactone,D-半乳糖內酯
  • 羧酸類
B1,Pyruvic Acid Methyl Ester,丙酮酸甲脂,B3,D-Galacturonic Acid,D-半乳糖醛酸
  • 氨基酸類,
A4,L-Arginine,L-精氨酸,B4,L-Asparagine,L-天冬酰胺酸,E4,L-Threonine,L-蘇氨酸F4,Glycyl-L-Glutamic Acid,甘氨酰-L-谷氨酸
  • 酚類 
  • 胺類
G4,Phenylethyl-amine,苯乙基胺H4,Putrescine,腐胺,E2,N-Acetyl-D-Glucosamine,N-乙酰基-D-葡萄胺
發布者:百徠普惠(北京)科技有限公司
聯系電話:010-64187568 13810885496
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