一、離心管中心線與旋轉軸角度不一樣：水平轉子靜止時，轉子中的離心管中心線與旋轉軸平行，旋轉加速時，中心線由平行位置逐漸過渡到與旋轉軸接近垂直的位置，降速時，離心管中心線由與旋轉軸接近垂直的位置逐漸趨向平行位置；角轉子中的離心管中心線與旋轉軸成20～40度的固定角度，角度越大，分離效果越好。

二、適用性不一樣：水平轉子可以做到大容量分離和利于從離心管中分層取出，不宜高速分離；角轉子不宜大容量分離，顆粒沉降時，先沿離心力方向撞向離心管，然后沿管壁滑向管底，管的一側會出現顆粒沉積而產生壁效應，影響分離效果，宜高速分離。

三、重心和阻力不一樣：水平轉子分離重心較高，阻力較大，有少量的壁效應；角轉子可以做到重心低，阻力小，運轉穩。

過濾式離心機的主要原理是通過高速運轉的離心轉鼓產生的離心力（配合適當的濾材），將固液混合液中的液相加速甩出轉鼓，而將固相留在轉鼓內，達到分離固體和液體的效果，或者俗稱脫水的效果。沉降式離心機的主要原理是通過轉子高速旋轉產生的強大的離心力，加快混合液中不同比重成分（固相或液相）的沉降速度，把樣品中不同沉降系數和浮力密度的物質分離開。

當含有細小顆粒的懸浮液靜置不動時，由于重力場的作用使得懸浮的顆粒逐漸下沉。粒子越重，下沉越快，反之密度比液體小的粒子就會上浮。微粒在重力場下移動的速度與微粒的大小、形態和密度有關，并且又與重力場的強度及液體的粘度有關。象紅血球大小的顆粒，直徑為數微米，就可以在通常重力作用下觀察到它們的沉降過程。

角轉子中的離心管能夠保持固定的角度離心，可以使用較高的轉速，離心后沉淀位于管底的斜面。較大容量的轉子通常可以配不同的“適配器”來“固定”小容量的樣品管，例如6 x 85ml的轉子每孔可以放置85ml的離心管，也可以放50ml或者15—20ml的離心管，實現一物多用；但是由于重量的負擔，大容量轉子的最高轉速相對小的要低一些，因而還要考慮最高離心力是否能滿足實驗要求。

水平轉子配有4或6個吊籃，靜止時垂直掛在轉子上，吊籃有不同的適配器以滿足不同容量的離心管的需要。當轉子轉速超過600rpm后離心管達到水平位置，樣品沉降方向是沿離心管軸向移動，最后沉降在管底，便于收集。因為不如固定角轉子穩固，水平吊籃最高轉速相比固定角轉子要低很多，限于低速離心的范圍。