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LightBench(全自動核酸電泳分析回收系統)助力ccfDNA檢測研究

瀏覽次數:6015 發布日期:2018-9-25  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

循環游離DNA(circulating cell-free DNA,ccfDNA)是人及動植物體液中、在細胞外,處于游離狀態的DNA 分子。作為一種非入侵性的疾病診斷標志物,ccfDNA的檢測有望替代目前的侵入性方法,在早期實現疾病的診斷和監控。因此ccfDNA在在液體活檢領域掀起一陣新風暴。

 

來源于腫瘤細胞的ccfDNA又稱為循環腫瘤DNA(Circulating cell-free DNA,ctDNA)。ctDNA含量與腫瘤進展階段密切相關,準確檢測ctDNA含量對腫瘤診斷和治療有十分重要的意義。然而相較于全部ccfDNA,血液里ctDNA的含量很少,表現為非常低的等位基因頻率。因此,通過PCR和三代測序的方法檢測超低濃度的ctDNA時,產生誤差的概率大大增加。全世界的科研工作者就如何降低這類誤差做出了許多探索。近日,美國科學家借助LightBench全自動核酸凝膠電泳成像分析回收系統,并將獨特應用發表了文獻《Automated size selection for short cell-free DNA fragments enriches for circulating tumor DNA and improves error correction during next generation sequencing》。研究指出,通過提取較短片段的ccfDNA可以提高ctDNA的基因頻率,從而實現ctDNA的富集并且減少PCR和測序結果的誤差。

 

LightBench能對每個泳道電壓獨立控制,可使得從25bp至基因組大小的目標片段同時到達回收孔,從而實現全自動富集回收。基于LightBench的這一功能,研究人員對黑色素瘤患者的ccfDNA富集回收分析,分離得到了較小片段的ccfDNA,并通過后續PCR及測序證實了此方法可以準確且可重復地分離目標片段大小ccfDNA。

 

  

接下來,研究人員對分離得到的較短片段的ccfDNA進行研究,對其中的目標ctDNA進行PCR擴增和測序,檢測ctDNA含量。結果顯示,較短片段的ccfDNA亞群中,ctDNA含量相對較高,實現了富集。

 

     

并且,研究人員對健康患者富集后的ctDNA和未經過富集的ctDNA進行了檢測,并統計假陽性概率。結果顯示較高的ctDNA含量可以減少結果的誤差。

 

 

綜上所述,基于LightBench全自動核酸凝膠電泳成像分析回收系統,研究人員分離得到了較短片段的ccfDNA,并實現了ctDNA的富集。從而降低腫瘤液體活檢過程中出現假陽性結果的概率,提高了腫瘤篩查和診斷準確性,大大提高了將這些研究結果轉化為臨床應用的潛力。

 

關于LightBench全自動核酸電泳成像分析回收系統

LightBench全自動核酸電泳成像分析回收系統,是Coastal Genomics公司研發的集電泳圖譜分析、片段選擇回收、核酸濃度測定三大功能于一體的儀器。可以助您輕松完成枯燥繁瑣的瓊脂糖凝膠電泳實驗!

LightBench采用專利的Ranger Technoogy進行全自動凝膠電泳,每次運行可同時分析96份樣本,純化回收12份樣本,成像范圍從25bp至基因組大小,DNA回收率80%以上。同時兼容漢密爾頓機器人液體處理裝置,幫助用戶提升工作效率,簡化工作流程,快速實現高通量核酸分析及核酸片段回收。

普瑞麥迪(北京)實驗室技術有限公司于2018年5月正式成為Coastal Genomics中國區獨家總代,期待進一步推進中國市場核酸研究與檢測領域的發展!同時誠邀全國各區合作伙伴與我們攜手合作!

 

LightBench技術優勢:

 

●  精確的片段長度分析:25bp-基因組大小

●  低成本的片段全自動純化回收

●  高靈敏度檢測:200pg-1000ng;

●  高效率:96 個DNA片段長度分析<30min

●  全自動樣品追蹤

● 靈活兼容液體處理裝置及核酸定量試劑

 

LightBench可應用于以下應用領域

 

●  三代測序

●  CFDNA富集

●  液體活檢

●  考古等稀有DNA富集

·基因合成

·基因克隆

·基因測序

·基因分型

·核酸定量分析

·限制性片段長度分析

發布者:普瑞麥迪(北京)實驗室技術有限公司
聯系電話:4006-813-863
E-mail:hzhang@premedlab.com

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