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代謝組學(xué)全流程解決方案

瀏覽次數(shù):7496 發(fā)布日期:2017-1-9  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

賽默飛基于其超高分辨的靜電場(chǎng)軌道阱(Orbitrap)質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合其功能強(qiáng)大的軟件平臺(tái),提供代謝組學(xué)全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測(cè)、峰提取與定量、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析與可視化作圖、代謝產(chǎn)物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求,而且還整合了從非靶標(biāo)生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)到靶標(biāo)生物標(biāo)記物驗(yàn)證的代謝組學(xué)不同層次的分析需求。

代謝組學(xué)全流程工作流程

卓越的硬件方案

賽默飛的 Orbitrap 技術(shù)作為近 30 年來(lái)全新的一種質(zhì)譜技術(shù),其超高的分辨率、卓越的質(zhì)量精度、優(yōu)異的靈敏度、極佳的穩(wěn)定性及與 QQQ 媲美的定量能力使其可以全面地迎接代謝組學(xué)的挑戰(zhàn),成為代謝組學(xué)研究強(qiáng)大的分析平臺(tái)。

一、超高的分辨率

消除復(fù)雜基質(zhì)的干擾,全面的檢測(cè)代謝組  代謝組學(xué)分析的樣品基質(zhì)復(fù)雜,且需要在有限的分析時(shí)間內(nèi)盡可能實(shí)現(xiàn)全組分的同時(shí)檢測(cè),而超高的分辨率對(duì)于分析那些基質(zhì)復(fù)雜,干擾大的樣品尤為重要。

提供當(dāng)前代謝組學(xué)前沿的研究領(lǐng)域代謝流組(Fluxomics)對(duì)于分辨率的超高需求  代謝流組通過(guò)對(duì)體內(nèi)代謝物的標(biāo)記,來(lái)實(shí)現(xiàn)有效的追蹤代謝物在代謝網(wǎng)絡(luò)中的流向和規(guī)律,是當(dāng)今代謝組學(xué)研究的熱點(diǎn)及前沿領(lǐng)域。在代謝流組的研究上,超高的分辨率更顯的重要。

二、高質(zhì)量精度

確保MS色譜峰每一個(gè)點(diǎn)的高質(zhì)量精度  不同于一般的高分辨質(zhì)譜,Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)基于其獨(dú)特的原理及穩(wěn)定性,可以確保色譜峰中每一個(gè)采集點(diǎn)都可獲得小于1ppm的質(zhì)量精度,確保代謝物元素組成的準(zhǔn)確計(jì)算。

同時(shí)提供 MSMS 小于1 ppm 的質(zhì)量精度  Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)可同時(shí)提供 MSMS 小于 1 ppm的質(zhì)量精度,這對(duì)確保代謝物結(jié)構(gòu)的精細(xì)鑒定至關(guān)重要。

三、與QQQ媲美的定量能力

一個(gè)平臺(tái)即可實(shí)現(xiàn)非靶標(biāo)定性/靶標(biāo)定量分析的完美整合  Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)提供高靈敏、5 個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)范圍及靈活多樣的定量掃描模式,定性的同時(shí)具有極佳的定量能力。

四、極佳的穩(wěn)定性

滿足代謝組學(xué)分析對(duì)于重現(xiàn)性的高度要求  Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)因其獨(dú)特的結(jié)構(gòu)及設(shè)計(jì),提供代謝組學(xué)分析所需要的在質(zhì)量精度、響應(yīng)強(qiáng)度上的高重現(xiàn)性質(zhì)譜數(shù)據(jù),為組間的生物學(xué)差異比較提供可靠的基礎(chǔ)。

五、有效的正負(fù)離子切換掃描

提供大樣本分析的高通量  Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)可以實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)正負(fù)切換掃描功能,一次進(jìn)樣即同時(shí)獲取正離子及負(fù)離子圖譜,且不損失靈敏度和質(zhì)量精度,可以大大提高代謝組學(xué)大樣本分析的實(shí)驗(yàn)通量。

強(qiáng)大的軟件方案

基于Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)采集的高質(zhì)量原始數(shù)據(jù),賽默飛提供全面、強(qiáng)大的軟件平臺(tái)實(shí)現(xiàn)對(duì)代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)挖掘。

一、SIEVE 軟件—專(zhuān)業(yè)的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理、信息挖掘軟件

• 獨(dú)特的組分提取算法,綜合考慮歸屬于一個(gè)代謝物的所有質(zhì)譜離子響應(yīng);
• 精細(xì)同位素匹配算法,更準(zhǔn)確判斷代謝物元素組成;
• 主成分分析、T 檢驗(yàn)等代謝組學(xué)統(tǒng)計(jì)模塊;
• 與 KEGG 等多種常用代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)聯(lián),可自動(dòng)對(duì)差異成分進(jìn)行搜庫(kù)鑒定;
• Pathway Mapping。

二、強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫(kù)譜庫(kù)及結(jié)構(gòu)解析軟件

 mzCloud—多級(jí)譜庫(kù)及全未知代謝物結(jié)構(gòu)解析;
• SIEVE 在 線 關(guān) 聯(lián) HMDB、KEGG 等常用代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù);
• Mass Frontier 軟件—自動(dòng)質(zhì)譜譜圖結(jié)構(gòu)解析軟件,F(xiàn)ragmentation Library TM碎裂譜圖庫(kù),涵蓋了大于99%已發(fā)表的文獻(xiàn)涉及的碎裂機(jī)理,可對(duì)化合物的碎片離子進(jìn)行預(yù)測(cè),特有的包含15萬(wàn)以上化學(xué)結(jié)構(gòu)式及3萬(wàn)以上碎片圖。

三、TraceFinder 軟件—高通量譜庫(kù)檢索及定量軟件

• 建立譜圖數(shù)據(jù)庫(kù),便于數(shù)據(jù)管理,并可對(duì)化合物進(jìn)行搜庫(kù)鑒定;
• 高通量目標(biāo)代謝物篩查鑒定;
• 目標(biāo)代謝物的高通量定量分析及熱圖;
• 定性篩查結(jié)果與定量方法的自動(dòng)轉(zhuǎn)化。

基于 Orbitrap 超高分辨質(zhì)譜平臺(tái)的代謝組學(xué)全流程解決方案,可以提供當(dāng)今代謝組學(xué)研究最優(yōu)異的平臺(tái),在疾病生物標(biāo)記物的尋找、食品組學(xué)、中醫(yī)藥等諸多領(lǐng)域全面迎接代謝組學(xué)研究的挑戰(zhàn)。

發(fā)布者:賽默飛世爾科技(色譜與質(zhì)譜)
聯(lián)系電話:13386161207
E-mail:ping.shen2@thermofisher.com

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