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干貨分享:小鼠內臟組織樣品研磨提取核酸、微生物案例及問題答疑

瀏覽次數:7188 發布日期:2016-12-30  來源:DHS
 干貨分享:小鼠內臟組織樣品研磨提取核酸、微生物
 
近期的組織研磨和樣品處理分享、討論,我們邀請到了實驗動物監測所袁老師給大家分享,內容是——小鼠內臟組織樣品研磨提取核酸、微生物,研磨使用的儀器是鼎昊源TL2020組織研磨儀。
 
那接下來,就讓我們先睹為快,看看這個案例的情況。
 
實例1:加裂解液直接勻漿(使用Trizol提取組織RNA)
1、取適量組織裝入離心管,組織盡量剪碎成小塊;
2、在離心管中加入氧化鋯珠數顆(一次性使用);
3、先加入Trizol(不建議加入太多 Trizol,液體體積過大影響勻漿效果),蓋好管蓋,裝入鼎昊源TL2020組織研磨儀適配器中,安裝上機。
4、組織研磨儀研磨參數設置為一定轉速,研磨時間為2~5min(不同組織研磨時間不同,腦1min,肝臟、脾臟和腎臟2min、肺臟比較難研磨需3~5min,可能更長,中間應停頓1~2次防止溫度過高,研磨前最好先用液氮或放置在-80度冰箱預冷);
5、再加入適量Trizol至總體積;
6、后面步驟按Trizol說明進行。
 
實例2:先勻漿,再取一定量液體加裂解液進行核酸抽提,本protocol適用提取小鼠組織中的病毒的核酸
1、取適量組織裝入離心管,組織盡量剪碎成小塊,樣品量較多時使用大離心管;
2、在離心管中加入氧化鋯珠數顆,使用大離心管時,可以將氧化鋯珠數量增加;
3、加入適量的滅菌PBS或生理鹽水,總體積為離心管單管體積的1/3~1/2為好,蓋好管蓋,裝入鼎昊源TL2020組織研磨儀適配器中,安裝上機(研磨前最好先用液氮或放置在-80度冰箱預冷)。
4、TL2020組織研磨儀研磨參數設置為一定轉速,研磨時間為1~5min(不同組織研磨時間不同,腦1min,肝臟、脾臟和腎臟2min、肺臟比較難研磨需3~5min,可能更長,中間應停頓1~2次防止溫度過高),若研磨不充分,可以繼續研磨到充分為止;
5、一定溫度、轉速,離心數分鐘;
6、取上清液按照試劑盒說明書進行后續提取步驟。
實驗1中,我們之前試過一齊加1ml的Trizol,可能是體積過大,反而勻漿效果不好,所以就改成先加一部分裂解先勻漿,然后再補齊1ml體積。
 
嘉賓:實驗1中,我們之前試過一齊加1ml的Trizol,可能是體積過大,反而勻漿效果不好,所以就改成先加一部分裂解先勻漿,然后再補齊1ml體積。
 
昊諾斯嘉賓:如果前面勻漿充分了,后面補齊裂解后不需要再研磨的,只需稍微混勻就可以。
 
用戶:可以選擇干磨嗎?就組織直接扔進去弄成勻漿或者粉末,我再根據需要加trizol或者蛋白裂解液
 
嘉賓:跟大家分享下,我們最近用組織研磨儀用于抗原加佐劑的乳化,效果還不錯。一機兩用。
 
嘉賓:組織干磨效果不好,需要加入適量的液體,沒有液體很多組織掛在壁上。
 
用戶:提取下的核酸用途是什么?這個是我最關心的。
 
嘉賓:我們用于病原微生物檢測。
 
用戶:怎么個檢測法您能給我簡單介紹一下嗎?
 
嘉賓:所以我們用的最多的是實驗2,先勻漿,破碎組織,釋放組織細胞中的病毒。
 
嘉賓:主要采用PCR為基礎的分子生物學檢測。
 
用戶:嗯,PCR,我知道了,謝謝。
 
嘉賓:不客氣。一般的組織核酸抽提試劑盒中,都會有一部勻漿的步驟。
 
嘉賓:以前沒有研磨儀的時候都是用研缽手工勻漿,一天幾十上百個樣品,累成狗。
 
用戶:研磨如果用液氮處理,里面的液體不會凍住嗎?
 
用戶:我也有這個疑問,看來這個儀器是核酸分析必須的。
 
嘉賓:開始會凍住,等研磨到一定時間就自然解凍了,我們處理時只是讓它預冷一下,最好不要凍住。所以一般是放在-80度冰箱稍預冷一下就可以了
 
用戶:嗯!
 
用戶:謝謝
 
嘉賓:是的,核酸檢測必備。
 
用戶:早些天我看一個打沙棘的視頻,凍掉以后,直接就打下來了,所以冷凍還是有效果的,原理是一樣的。
 
嘉賓:還要講一下,選質量好的EP管,現在一些國產的EP管質量太差,蓋不嚴,導致液體漏出。如果預冷的話,一些EP管就可能被打碎了,我們有過這樣的例子。
 
用戶:我們也因為質量不好的EP管影響過實驗,所以試劑耗材也很重要。
 
嘉賓:同意。
 
用戶:一定要選擇質量有保證的產品。
 
嘉賓:是啊。關于振動頻率說明一下,我們選的頻率比較高,我看到有的資料上講一般動物樣品如大腦、心臟、肺、胃、肝臟等無骨骼組織的研磨推薦頻率是1000-1100r/min研磨時間是1-2min,具體的頻率可根據樣品材料及數量的不同,做適當的調整。過大的頻率或者時間都可能會導致部分DNA的斷裂,建議每次研磨時間在1mm左右,中間停頓一會,重復2-3次。
 
用戶:謝謝袁老師。
發布者:鼎昊源(天津)生物科技有限公司
聯系電話:010-58650065
E-mail:chenyajing@herosbio.com

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