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生物層干涉技術在中藥研究中的應用

瀏覽次數:1897 發布日期:2022-5-16  來源:賽多利斯
中藥的有效成分是其藥理作用的基礎,運用現代科學技術和手段研究、揭示中藥的多成分、多分子效應機制,是當今中藥學研究和發展的基本方向。通過研究中藥有效成分與生物大分子之間的關系,有助于中藥藥理作用機制的研究和藥物篩選,更有利于疾病的檢測預防和靶向治療。近年來,基于生物層干涉技術(Biolayer Interferometry,BLI)的Octet®非標記分子互作分析系統在中藥調節信號通路傳導、中藥靶向治療等方面的應用有了快速的發展[1]。

中藥有效成分靶點互作研究 [2]
南京中醫藥大學

通過親和層析篩選與人參皂苷主要成分相互作用的蛋白,鑒定出14-3-3ζ蛋白為人參皂苷在腦組織中的潛在靶點。使用Octet®鑒定了20(S)- prototopanaxadiol (PPD,人參皂苷的代謝物)與14-3-3ζ 蛋白的直接相互作用(圖1)。14-3-3ζ蛋白-PPD復合物的共晶體結構表明,14-3-3ζ蛋白的R56、R127和Y128氨基酸殘基參與與PPD互作,其中任何一個殘基突變都會導致PPD與14-3-3ζ蛋白的親和力顯著降低。該研究結果有助于更好地了解人參調節神經元活性的作用機制,為基于人參皂苷結構開發與14-3-3ζ結合的小分子化合物奠定基礎。

圖1. 上半部分為中藥新靶點發現與鑒定的技術路線:BLI(Octet®)主要用于鑒定靶點(14-3-3 ζ蛋白)與人參皂苷的結合;下半部分表格為靶點突變體與人參皂苷的親和力測定。

用靶點垂釣有效成分[3]
西南醫科大學

BLI生物層干涉技術與高分辨質譜聯合使用,并以Aβ作為誘餌來垂釣中藥開心散(由遠志、人參、茯苓和石菖蒲這4味中藥組成)中可以與Aβ相互結合的潛在小分子抑制劑。


1.將Aβ結合在Octet®傳感器上,然后將開心散提取液與傳感器上的Aβ進行結合并解離;
2.將收集到的解離液應用高分辨質譜進行分析并鑒定,發現去氫土莫酸(DTA)、豬苓酸C(PPAC)和土莫酸(TA)三個化合物與Aβ有著最強的結合力;
3.通過色譜分離制備出這三個化合物后,然后在AD的細胞和線蟲模型上對這些化合物的抑制Aβ纖維形成的活性進行了評價;
4.研究發現,這些化合物在體內外均有很好的抑制Aβ纖維形成的活性(圖2):

圖2. 純化的TA與Aβ的親和力檢測

天然產物構效關系研究[4]
中國藥科大學

CDC37是一種新的腫瘤治療靶點,天然產物雷公藤紅素(celastrol)能夠很好的抑制該靶點活性。現在從celastrol的基本結構(三萜)出發,合成了一系列化合物,用Octet®測定了所有化合物與藥物靶點CDC37相互作用。

1#化合物替換了A環的酮基,11#化合物改變了A環的羥基極性,BLI親和力測試發現,1#的親和力為90 μM,而11#化合物則無法與蛋白結合。說明A環的羥基極性對保持其活性是非常重要的(圖3)。
 
圖3. 左邊為Octet® Red 96測定的Celastrol衍生物與CDC37的親和力,右邊為根據BLI結果得出的化合物構效關系

天然化合物庫篩選和小分子競爭實驗[5]
澳門科技大學

基于分子對接并結合Octet®互作儀在天然化合物中篩選潛在SARS-CoV-2抑制劑。一些天然化合物抑制SARS-CoV-2誘導的Vero E6細胞的病變效應和斑塊形成,使其喪失明顯的動物毒性并具有SARS-CoV-2假病毒突變體(D614G、N501Y、N439K和Y453F)的抗病毒效果。通過Octet®還發現,一些天然產物,比如EGCG、Bkc和Ibvc還與ACE2受體結合,體現與RBD和ACE2雙重結合。Octet®還可以進行小分子之間的競爭實驗,對小分子在蛋白靶點上的結合位點進行分組(圖4)。

與RBD結合的一系列天然化合物

 
圖4. Octet®小分子競爭實驗:綠色為相互不競爭,紅色為相互競爭

BLI 技術在中藥開發及研究領域的應用優勢:

●節約樣品:只需要μg級的蛋白量和μM級的小分子量;
●避免損失:沒有復雜的流路系統,也沒有泵和進樣系統,減少樣品的損失;
●經濟高效:實驗后還可將剩余樣品進行回收,減少了前期純化樣品的工作量;
●快速便捷:耗時短,同時可以檢測多種樣品,實時監控檢測結果,在前期中藥篩選階段,可以提高效率,節約寶貴時間。

BLI 技術被廣泛應用于中藥研究中,成為中藥分子機制研究的主流技術,為中醫藥走向世界提供有力的支持與保障。

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參考文獻

1.《生物膜干涉技術在中藥研究的應用》. 中國商品學會第五屆全國中藥商品學術大會
2.Identification and confirmation of 14-3-3 ζ as a novel target of ginsenosides in brain tissues,Journal of Ginseng Research,2020,1226-8453
3.High-throughput screening for amyloid-β binding natural small-molecules based on the combinational use of biolayer interferometry and UHPLCLDAD-Q/TOF-MS/MS. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2021.
4.Betulinic acid acetate, an antiproliferative natural product, suppresses client proteins of heat shock protein pathways through a CDC37-binding mechanism。RSC Adv., 2016, 6, 42537
5.Identification of natural compounds as SARS-CoV-2 entry inhibitors by molecular docking-based virtual screening with bio-layer interferometry. Pharmacological Research 172 (2021) 105820
發布者:德國賽多利斯集團
聯系電話:實驗室產品與服務事業部:400 920 9889 / 生物工藝解決方案事業部:400 680 1870
E-mail:info.cn@sartorius.com

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