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DNA編碼化合物庫技術(shù)在化合物篩選上的作用

瀏覽次數(shù):1049 發(fā)布日期:2020-2-26  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
伴隨著組合化學(xué)技術(shù)的發(fā)展,出現(xiàn)了成千上萬的化合物,為大規(guī)模的藥物篩選創(chuàng)造了物質(zhì)基礎(chǔ)。為了進(jìn)行高效、高速、低成本的化合物篩選,最大限度地發(fā)現(xiàn)藥物,高通量篩選技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生并快速發(fā)展起來。在藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域,DNA編碼化合物庫是一項(xiàng)可以在上億化合物中進(jìn)行化合物篩選,發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物以支持新藥發(fā)現(xiàn)的前沿技術(shù)。該技術(shù)平臺的建立在加快與優(yōu)化藥物研發(fā)的進(jìn)程,降低研發(fā)成本方面起到了很大的作用。

DNA編碼化合物庫(DEL)技術(shù)通過合成并篩選數(shù)以億計(jì)的海量化合物,已發(fā)現(xiàn)具有新型結(jié)構(gòu)的化合物,是利用組合化學(xué)的合成概念和DNA技術(shù)相結(jié)合而實(shí)現(xiàn)的。DNA編碼化合物庫篩選是將蛋白和整個(gè)化合物庫進(jìn)行篩選,是數(shù)量巨大的化合物同時(shí)篩選而不是傳統(tǒng)的單個(gè)的化合物依次篩選。目前DEL技術(shù)不僅僅限于基礎(chǔ)研究,已被國內(nèi)外主要制藥企業(yè)廣泛采用,在藥物研發(fā)中可拓展化合物篩選效果和提高先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)概率,用這個(gè)技術(shù)發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物,然后進(jìn)行先導(dǎo)化合物優(yōu)化后才能成為臨床候選物。
與傳統(tǒng)藥物篩選技術(shù)相比,DEL技術(shù)是一項(xiàng)新的高通量篩選技術(shù),具有成本低、耗時(shí)短、效率高等優(yōu)勢,目前國內(nèi)已有多家企業(yè)布局DEL技術(shù)。美迪西藥物化學(xué)服務(wù)可以為客戶提供藥物化學(xué)、藥物篩選服務(wù)、新藥研發(fā)服務(wù)、先導(dǎo)化合物優(yōu)化等,能夠?yàn)榭蛻籼峁┖w各種靶標(biāo)和疾病領(lǐng)域的新藥研發(fā)外包服務(wù),包括從活性化合物發(fā)現(xiàn), 靶標(biāo)驗(yàn)證,先導(dǎo)化合物優(yōu)化到臨床前候選藥物的選擇。

DNA編碼化合物庫技術(shù)的主要操作步驟如下,首先是DNA編碼化合物庫的合成;然后是靶向蛋白親和力篩選、 PCR擴(kuò)增、DNA高通量測序,接下來是編碼翻譯、化學(xué)結(jié)構(gòu)分析、 非編碼化合物重新合成和化合物與靶向蛋白生物活性驗(yàn)證。

DNA編碼化合物庫篩選技術(shù)的原理用一段特異的DNA序列來標(biāo)記反應(yīng)過程中的每一個(gè)小分子化合物,用組合化學(xué)的策略來大量合成百萬級至百億級連接有DNA序列的化合物文庫。將DEL與目標(biāo)蛋白進(jìn)行親和篩選,洗脫除去未與目標(biāo)蛋白結(jié)合的化合物,從而得到能與蛋白結(jié)合的化合物集合。這些小分子化合物的DNA標(biāo)記序列通過PCR擴(kuò)增放大后由基因測序檢測。因?yàn)镈NA序列和小分子化合物一一對應(yīng),研發(fā)人員只需讀取與目標(biāo)蛋白結(jié)合的分子上的DNA序列,即可解碼得到對應(yīng)的分子結(jié)構(gòu)式[1]。

目前DNA編碼化合物庫技術(shù)已經(jīng)廣泛適用于新藥研發(fā)領(lǐng)域的先導(dǎo)化合物的合成和化合物篩選當(dāng)中,并且起到了非常大的作用。有文章報(bào)道,目前國內(nèi)外的藥物研發(fā)企業(yè)及其他科研機(jī)構(gòu),基于DNA編碼化合物庫,已經(jīng)篩選出數(shù)量眾多的活躍的苗頭化合物,涵蓋了小分子活性化合物和大環(huán)活性化合物,IC50最低達(dá)到0.3nmol。

DEL平臺目前已經(jīng)取得了顯著的發(fā)展,成為在高通量篩選之外的重要的化合物篩選工具。DNA編包服務(wù),包括從活性化合物發(fā)現(xiàn), 靶標(biāo)驗(yàn)證,先導(dǎo)化合物優(yōu)化到臨床前候選藥物的選擇。

DNA編碼化合物庫技術(shù)的主要操作步驟如下,首先是DNA編碼化合物庫的合成;然后是靶向蛋白親和力篩選、 PCR擴(kuò)增、DNA高通量測序,接下來是編碼翻譯、化學(xué)結(jié)構(gòu)分析、 非編碼化合物重新合成和化合物與靶向蛋白生物活性驗(yàn)證。

DNA編碼化合物庫篩選技術(shù)的原理用一段特異的DNA序列來標(biāo)記反應(yīng)過程中的每一個(gè)小分子化合物,用組合化學(xué)的策略來大量合成百萬級至百億級連接有DNA序列的化合物文庫。將DEL與目標(biāo)蛋白進(jìn)行親和篩選,洗脫除去未與目標(biāo)蛋白結(jié)合的化合物,從而得到能與蛋白結(jié)合的化合物集合。這些小分子化合物的DNA標(biāo)記序列通過PCR擴(kuò)增放大后由基因測序檢測。因?yàn)镈NA序列和小分子化合物一一對應(yīng),研發(fā)人員只需讀取與目標(biāo)蛋白結(jié)合的分子上的DNA序列,即可解碼得到對應(yīng)的分子結(jié)構(gòu)式[1]。

目前DNA編碼化合物庫技術(shù)已經(jīng)廣泛適用于新藥研發(fā)領(lǐng)域的先導(dǎo)化合物的合成和化合物篩選當(dāng)中,并且起到了非常大的作用。有文章報(bào)道,目前國內(nèi)外的藥物研發(fā)企業(yè)及其他科研機(jī)構(gòu),基于DNA編碼化合物庫,已經(jīng)篩選出數(shù)量眾多的活躍的苗頭化合物,涵蓋了小分子活性化合物和大環(huán)活性化合物,IC50最低達(dá)到0.3nmol。

DEL平臺目前已經(jīng)取得了顯著的發(fā)展,成為在高通量篩選之外的重要的化合物篩選工具。DNA編碼化合物庫篩選技術(shù)因其巨大的潛力成為了一種強(qiáng)有力的新藥篩選工具,在未來具有廣闊的發(fā)展前景。

[1] DNA編碼化合物庫在藥物篩選和發(fā)現(xiàn)中的研究與應(yīng)用[J].
 
 
發(fā)布者:上海美迪西生物醫(yī)藥有限公司
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