Scienion點(diǎn)樣儀二月文獻(xiàn)速遞匯總閱讀
關(guān)于 SCIENION
SCIENION是一家在超低液量噴點(diǎn)技術(shù)方面優(yōu)越的全球性設(shè)備制造商。適合將寡核苷酸，蛋白質(zhì)，抗體和聚糖等試劑裝載到生物芯片或相關(guān)診斷器械上。Scienion的點(diǎn)樣儀有著高效、精確的點(diǎn)樣能力和解決方案，可以顯著提升這項(xiàng)研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和結(jié)果的可靠性，提高實(shí)驗(yàn)效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量，從而推動(dòng)臨床診斷工具的發(fā)展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文獻(xiàn)鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
這篇文章主要探討了蛋白質(zhì)選擇性（即蛋白質(zhì)如何區(qū)分優(yōu)選和非優(yōu)選配體）的機(jī)制，特別是通過(guò)研究人類轉(zhuǎn)錄因子MAX的變異體如何影響DNA序列的特異性和選擇性。研究的核心目標(biāo)是揭示影響轉(zhuǎn)錄因子對(duì)DNA結(jié)合選擇性的生物物理機(jī)制，這對(duì)預(yù)測(cè)生物功能和蛋白質(zhì)工程具有重要意義。研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了構(gòu)象異質(zhì)性在決定序列選擇性方面的重要性，并為未來(lái)的選擇性蛋白質(zhì)工程提供了指導(dǎo)。這些結(jié)果突顯了構(gòu)象異質(zhì)性在決定序列選擇性方面的重要性，并可指導(dǎo)未來(lái)設(shè)計(jì)選擇性蛋白質(zhì)的工作。
02
文獻(xiàn)鏈接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
這篇文章研究了硫酸軟骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化對(duì)其與血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子（VEGF-A）和成纖維生長(zhǎng)因子2（FGF-2）結(jié)合的影響，旨在探討CS在抗腫瘤血管生成中的作用及其機(jī)制。
通過(guò)將糖鏈微陣列與計(jì)算模型相結(jié)合，研究揭示了CS的結(jié)構(gòu)與其與促血管生成因子相互作用之間的關(guān)系。研究結(jié)果表明，在設(shè)計(jì)抗血管生成藥物時(shí)，應(yīng)考慮CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。總體而言，這項(xiàng)研究為理解CS的生物學(xué)功能提供了新的見(jiàn)解，并為開(kāi)發(fā)更有效的抗血管生成藥物提供了理論基礎(chǔ)。
03
文獻(xiàn)鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
這篇文章主要討論了宮頸癌的預(yù)防、檢測(cè)和診斷，特別是在資源有限的環(huán)境中面臨的挑戰(zhàn)。盡管宮頸癌可以通過(guò)篩查和治療宮頸癌前期病變來(lái)預(yù)防，但在低收入和中等收入國(guó)家（LMICs）中，宮頸癌的負(fù)擔(dān)仍然很高，部分原因是缺乏負(fù)擔(dān)得起且易于使用的篩查和診斷測(cè)試。
研究還展示了該測(cè)試在細(xì)胞樣本中的臨床相關(guān)檢測(cè)下限，并通過(guò)一項(xiàng)小型試點(diǎn)研究（n=19）驗(yàn)證了其臨床性能，結(jié)果顯示該紙基HPV E7測(cè)試在與宮頸上皮內(nèi)瘤變等級(jí)2或以上（CIN2+）的組織病理學(xué)診斷相比時(shí)，準(zhǔn)確率高達(dá)95%。文章最后提到，通過(guò)進(jìn)一步的臨床驗(yàn)證，這種檢測(cè)方法可以實(shí)現(xiàn)高度特異性的宮頸癌前病變和癌癥的床旁檢測(cè)，無(wú)需儀器，價(jià)格低廉，非常適合在資源有限的環(huán)境中使用。總體而言，這項(xiàng)研究為宮頸癌的早期檢測(cè)提供了一種創(chuàng)新的、可行的解決方案，旨在減少資源有限地區(qū)的疾病負(fù)擔(dān)。
04
文獻(xiàn)鏈接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文獻(xiàn)鏈接打開(kāi)可能需連接 VPN
這篇文章主要介紹了一種新的微流控平臺(tái)——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解決蛋白質(zhì)折疊過(guò)程中對(duì)動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性測(cè)量的挑戰(zhàn)。文章指出，盡管蛋白質(zhì)在折疊后會(huì)短暫地采樣未折疊或部分未折疊的中間體，這些中間體往往容易發(fā)生不可逆的改變（如蛋白水解、聚集或后翻譯修飾），并且動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性除了熱力學(xué)穩(wěn)定性之外，還會(huì)直接影響蛋白質(zhì)的壽命、豐度以及形成替代的、可能破壞性的狀態(tài)。文章展示了SPARKfold的能力和潛力，通過(guò)并行測(cè)定1,104個(gè)蛋白樣本的展開(kāi)速率常數(shù)。通過(guò)SPARKfold比較突變對(duì)動(dòng)力學(xué)效應(yīng)的影響，并結(jié)合之前發(fā)表的折疊熱力學(xué)測(cè)量，研究者獲取了關(guān)于折疊過(guò)渡態(tài)和路徑的信息。未來(lái)的研究中，SPARKfold可以揭示驅(qū)動(dòng)錯(cuò)誤折疊和聚集的突變，并促進(jìn)對(duì)在惡劣環(huán)境中工業(yè)應(yīng)用的動(dòng)力學(xué)超穩(wěn)定變體的理性設(shè)計(jì)。
05
文獻(xiàn)下載鏈接：
https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
這篇文章主要研究了外泌體(extracellular vesicles, EVs)在細(xì)胞受到細(xì)胞毒性環(huán)境影響時(shí)的特征，特別是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)這種多環(huán)芳烴下的情況。文章強(qiáng)調(diào)了EVs作為生物標(biāo)志物在多種疾病和治療應(yīng)用中的潛力，并提供了對(duì)來(lái)自人類微血管內(nèi)皮細(xì)胞(HMEC-1)產(chǎn)生的10K EVs的深入表征。結(jié)果表明，B[a]P暴露可能導(dǎo)致EV的大小增加和標(biāo)記物表達(dá)的變化，指示在細(xì)胞毒性壓力下EV的表型發(fā)生了轉(zhuǎn)變。這項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了SPRi 和 AFM 在鑒定與細(xì)胞毒性反應(yīng)相關(guān)的EV標(biāo)記物方面的作用，為了解 EV的異質(zhì)性提供了深刻見(jiàn)解。
06
文獻(xiàn)鏈接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
這篇文章主要研究了植物細(xì)胞壁在植物免疫中的作用，特別是細(xì)胞壁衍生分子（如損傷相關(guān)分子模式，DAMPs）在免疫信號(hào)傳導(dǎo)中的潛力。雖然已知來(lái)自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他細(xì)胞壁成分的免疫信號(hào)潛力仍然沒(méi)有得到充分探討。此研究還鑒定了與ARM受體相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖結(jié)構(gòu)，并發(fā)現(xiàn)ARM受體在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法為發(fā)現(xiàn)植物中的糖類-受體配對(duì)提供了一個(gè)強(qiáng)大的平臺(tái)，拓展了對(duì)植物免疫機(jī)制的理解。
SCIENION是一家在超低液量噴點(diǎn)技術(shù)方面優(yōu)越的全球性設(shè)備制造商。適合將寡核苷酸，蛋白質(zhì)，抗體和聚糖等試劑裝載到生物芯片或相關(guān)診斷器械上。Scienion的點(diǎn)樣儀有著高效、精確的點(diǎn)樣能力和解決方案，可以顯著提升這項(xiàng)研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和結(jié)果的可靠性，提高實(shí)驗(yàn)效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量，從而推動(dòng)臨床診斷工具的發(fā)展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文獻(xiàn)鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
這篇文章主要探討了蛋白質(zhì)選擇性（即蛋白質(zhì)如何區(qū)分優(yōu)選和非優(yōu)選配體）的機(jī)制，特別是通過(guò)研究人類轉(zhuǎn)錄因子MAX的變異體如何影響DNA序列的特異性和選擇性。研究的核心目標(biāo)是揭示影響轉(zhuǎn)錄因子對(duì)DNA結(jié)合選擇性的生物物理機(jī)制，這對(duì)預(yù)測(cè)生物功能和蛋白質(zhì)工程具有重要意義。研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了構(gòu)象異質(zhì)性在決定序列選擇性方面的重要性，并為未來(lái)的選擇性蛋白質(zhì)工程提供了指導(dǎo)。這些結(jié)果突顯了構(gòu)象異質(zhì)性在決定序列選擇性方面的重要性，并可指導(dǎo)未來(lái)設(shè)計(jì)選擇性蛋白質(zhì)的工作。
02
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https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
這篇文章研究了硫酸軟骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化對(duì)其與血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子（VEGF-A）和成纖維生長(zhǎng)因子2（FGF-2）結(jié)合的影響，旨在探討CS在抗腫瘤血管生成中的作用及其機(jī)制。
通過(guò)將糖鏈微陣列與計(jì)算模型相結(jié)合，研究揭示了CS的結(jié)構(gòu)與其與促血管生成因子相互作用之間的關(guān)系。研究結(jié)果表明，在設(shè)計(jì)抗血管生成藥物時(shí)，應(yīng)考慮CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。總體而言，這項(xiàng)研究為理解CS的生物學(xué)功能提供了新的見(jiàn)解，并為開(kāi)發(fā)更有效的抗血管生成藥物提供了理論基礎(chǔ)。
03
文獻(xiàn)鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
這篇文章主要討論了宮頸癌的預(yù)防、檢測(cè)和診斷，特別是在資源有限的環(huán)境中面臨的挑戰(zhàn)。盡管宮頸癌可以通過(guò)篩查和治療宮頸癌前期病變來(lái)預(yù)防，但在低收入和中等收入國(guó)家（LMICs）中，宮頸癌的負(fù)擔(dān)仍然很高，部分原因是缺乏負(fù)擔(dān)得起且易于使用的篩查和診斷測(cè)試。
研究還展示了該測(cè)試在細(xì)胞樣本中的臨床相關(guān)檢測(cè)下限，并通過(guò)一項(xiàng)小型試點(diǎn)研究（n=19）驗(yàn)證了其臨床性能，結(jié)果顯示該紙基HPV E7測(cè)試在與宮頸上皮內(nèi)瘤變等級(jí)2或以上（CIN2+）的組織病理學(xué)診斷相比時(shí)，準(zhǔn)確率高達(dá)95%。文章最后提到，通過(guò)進(jìn)一步的臨床驗(yàn)證，這種檢測(cè)方法可以實(shí)現(xiàn)高度特異性的宮頸癌前病變和癌癥的床旁檢測(cè)，無(wú)需儀器，價(jià)格低廉，非常適合在資源有限的環(huán)境中使用。總體而言，這項(xiàng)研究為宮頸癌的早期檢測(cè)提供了一種創(chuàng)新的、可行的解決方案，旨在減少資源有限地區(qū)的疾病負(fù)擔(dān)。
04
文獻(xiàn)鏈接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文獻(xiàn)鏈接打開(kāi)可能需連接 VPN
這篇文章主要介紹了一種新的微流控平臺(tái)——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解決蛋白質(zhì)折疊過(guò)程中對(duì)動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性測(cè)量的挑戰(zhàn)。文章指出，盡管蛋白質(zhì)在折疊后會(huì)短暫地采樣未折疊或部分未折疊的中間體，這些中間體往往容易發(fā)生不可逆的改變（如蛋白水解、聚集或后翻譯修飾），并且動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性除了熱力學(xué)穩(wěn)定性之外，還會(huì)直接影響蛋白質(zhì)的壽命、豐度以及形成替代的、可能破壞性的狀態(tài)。文章展示了SPARKfold的能力和潛力，通過(guò)并行測(cè)定1,104個(gè)蛋白樣本的展開(kāi)速率常數(shù)。通過(guò)SPARKfold比較突變對(duì)動(dòng)力學(xué)效應(yīng)的影響，并結(jié)合之前發(fā)表的折疊熱力學(xué)測(cè)量，研究者獲取了關(guān)于折疊過(guò)渡態(tài)和路徑的信息。未來(lái)的研究中，SPARKfold可以揭示驅(qū)動(dòng)錯(cuò)誤折疊和聚集的突變，并促進(jìn)對(duì)在惡劣環(huán)境中工業(yè)應(yīng)用的動(dòng)力學(xué)超穩(wěn)定變體的理性設(shè)計(jì)。
05
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https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
這篇文章主要研究了外泌體(extracellular vesicles, EVs)在細(xì)胞受到細(xì)胞毒性環(huán)境影響時(shí)的特征，特別是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)這種多環(huán)芳烴下的情況。文章強(qiáng)調(diào)了EVs作為生物標(biāo)志物在多種疾病和治療應(yīng)用中的潛力，并提供了對(duì)來(lái)自人類微血管內(nèi)皮細(xì)胞(HMEC-1)產(chǎn)生的10K EVs的深入表征。結(jié)果表明，B[a]P暴露可能導(dǎo)致EV的大小增加和標(biāo)記物表達(dá)的變化，指示在細(xì)胞毒性壓力下EV的表型發(fā)生了轉(zhuǎn)變。這項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了SPRi 和 AFM 在鑒定與細(xì)胞毒性反應(yīng)相關(guān)的EV標(biāo)記物方面的作用，為了解 EV的異質(zhì)性提供了深刻見(jiàn)解。
06
文獻(xiàn)鏈接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
這篇文章主要研究了植物細(xì)胞壁在植物免疫中的作用，特別是細(xì)胞壁衍生分子（如損傷相關(guān)分子模式，DAMPs）在免疫信號(hào)傳導(dǎo)中的潛力。雖然已知來(lái)自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他細(xì)胞壁成分的免疫信號(hào)潛力仍然沒(méi)有得到充分探討。此研究還鑒定了與ARM受體相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖結(jié)構(gòu)，并發(fā)現(xiàn)ARM受體在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法為發(fā)現(xiàn)植物中的糖類-受體配對(duì)提供了一個(gè)強(qiáng)大的平臺(tái)，拓展了對(duì)植物免疫機(jī)制的理解。
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