DNA甲基化研究的三大前期探索性實驗思路介紹
瀏覽次數:632 發布日期:2023-3-29
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近些年以來,DNA甲基化研究一直是頂級期刊、基金資助、臨床研究、藥物研發上市的多重熱點,其研究方向涵蓋疾病發生發展、疾病標志物研究、環境因素暴露與響應、發育和分化等多維度。
研究人員為DNA甲基化課題申請作準備以及為降低DNA甲基化實驗風險,通常會進行DNA甲基化研究的前期探索性實驗,主要包括:
- 檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達
- 檢測整體DNA甲基化水平變化
- 其他前期實驗
一、檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達
方法包括:
- RT-qPCR檢測mRNA表達
- Western blot檢測蛋白質翻譯
e.g. 高脂飲食組和肥胖人群中均觀察到DNMT的RNA和蛋白質表達上調
二、檢測整體DNA甲基化水平變化
方法包括:
² 5mC甲基化免疫熒光染色(定性)
² DNA斑點雜交(定性)
² 比色法(定量)
² 質譜法(定量)
斑點雜交(Dot blot)
免疫熒光顯微觀察
比色法/質譜法
三、其他前期實驗
在沒有條件開展甲基化相關前期實驗的情況下,也可以開展其他預實驗。包括:
² 關鍵表型指標測定
² 轉錄組(成本低廉)
在進行前期探索性實驗后,DNA甲基化的研究思路與項目設計還包括:技術選擇、數據挖掘、下游驗證。