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Fluidity One-W在分析復雜背景中蛋白質的相互作用的應用

瀏覽次數:2593 發布日期:2020-6-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

Fluidic Analytics公司總部位于英國劍橋,致力于為實驗室、診所和其他用戶提供蛋白質研究的創新儀器、軟件和服務。目前Fluidic Analytics在歐洲、北美和亞洲有分公司和合作伙伴,并積極尋找新的合作伙伴。

Fluidity One-W是Fluidic Analytics公司開發的第二款產品,于2019年11月18日發布。這款產品基于劍橋大學開發的全新技術平臺,使科學家能夠在溶液中、在天然狀態下分析蛋白質的相互作用,不需要通過結合表面的固定。這也是開發這款產品的初衷,需要表面固定的檢測方法存在非特異性結合等干擾,并且真實的相互作用并非發生在固定表面,而是在溶液中。研究者們想尋求一種能在更接近真實的背景下分析相互作用的方法。Fluidity One-W可用于分析蛋白質的相互作用以及蛋白質復合物的結合比例,能夠為疾病診斷、治療開發和個人健康領域的研究提供很大的幫助。

檢測原理

(1)含有蛋白質樣品的液流被引入到旁邊的輔助流,蛋白質液流和輔助流是平行流動的,因為沒有對流混合,蛋白質遷移到輔助流的唯一方式是擴散。

 

(2)從左右的對比中,可以看到擴散的速度取決于蛋白質的大小。分子量小的蛋白擴散快,分子量大的蛋白擴散慢。

 

 

(3)標記過的樣品A和未標記的B混合,A、B結合而成的AB分子量大于A,于是擴散變慢。測定擴散和未擴散液流中A的數量,結合兩者的比值計算出流體動力學半徑(Rh)。A結合的比例越高,Rh越大。

 

 

(4)只有被標記的樣品才能被檢測到,因此Fluidity One-W可以檢測緩沖液、細胞裂解液或其他生物原液中的蛋白質,雜質不會影響測得的流體動力學半徑。

 

典型應用

分析復雜背景中蛋白質的相互作用

研究混合物諸如細胞裂解液或血漿中蛋白質-蛋白質,蛋白質-DNA和蛋白質-脂質的相互作用。非表面結合的原理避免了非特異性結合的干擾風險,因此您研究的是接近天然狀態下的蛋白質。

 

 

比較在0.05% 吐溫 20 (PBS-T)磷酸鹽緩沖液和FreeStyle™293培養基中,A蛋白 (SpA)與免疫球蛋白G (IgG)抗體的相互作用。結果表明,在兩種溶液中的結合親和力和流體動力學半徑均無顯著差異。

絲氨酸蛋白酶凝血酶與兩個預先標記的抗凝血酶配體HD22和TBA進行了測定。每個配體與凝血酶的不同表位相結合;這些相互作用先前已經被很好地描述過了。每個配體-蛋白復合物的結合親和力,以及復合物和配體的流體動力學半徑,都符合之前研究報告得到的數值。

研究分析難度大的蛋白質

雷帕霉素(Rapamycin)是一種大環內酯物化合物,可用于包被冠狀動脈支架, 防止器官移植排斥反應,可能也適用于抗癌治療,對人體具有免疫抑制作用。這些功能的關鍵在于它能夠同時結合兩個不同的蛋白質。雷帕霉素可與FKBP12和FRB同時結合。

無雷帕霉素(20 nM FKBP12-FITC + 1000 nM FRB)作為對照組。

FKBP12-FITC的濃度固定在20 nM。

雷帕霉素的濃度固定在50 nM。

用不同濃度的FRB測定FKBP12與FRB和雷帕霉素的結合。

 

測定化學計量學和結構

蛋白質大小的測量讓您可以深入了解蛋白質及其復合物的結構(結合比例)和化學計量學。

模型模擬了以1:1、1:2和1:3的比例結合的SpA-IgG復合物。紅色帶狀物代表SpA,藍色帶狀物代表IgG。用模型計算了三種比例結合物的 Rh 假設值(紅色條形)。將Fluidity One-W測得的 Rh平均值(藍色條形)與這些假設值做比較。紅色條形上添加了Rh預測值的10%作為誤差范圍,以表示模型中的最小不確定性。可以看到Fluidity One-W的測量值與1:3結合比例的SpA-IgG復合物的Rh 假設值相符。

產品特點

在溶液中檢測,樣品無需表面固定,是在自然狀態或接近自然狀態下的檢測方式,可以減少基于表面原理的非特異性結合現象
適用于各種類型的樣品,像細胞裂解液和血清等成分復雜的原液也無需純化,減少樣品純化的工作樣品量小,僅5 µL
可用于分析結合時的化學計量數,推測蛋白質復合物的結合比例
流體動力學半徑的變化和分子量的改變關系密切,可以反映蛋白質是否降解(穩定性),或進行品質控制
高再現性和精確度
易于使用的操作界面​
 

 

發布者:普瑞麥迪(北京)實驗室技術有限公司
聯系電話:4006-813-863
E-mail:hzhang@premedlab.com

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