一、核酸檢測實驗室應劃分為五個獨立的工作區。五個工作區應按照從清潔、半污染到污染的順序排列。各區內的試劑和耗材不能再進入任何“上游”區域。

（1）試劑配置和貯存區：本區的功能是實驗相關試劑（如核算提取液、乙醇等）的配置和貯存（包括商業化的試劑，如PCR反應緩沖液、Taq聚合酶和dNTPs等）。用于PCR擴增的試劑建議分裝后保存。

（2）樣品制備區：本區的功能為待檢樣品的保存、核酸的提取、貯存等。進行RNA檢測的實驗室，在此區域內應辟出專門的RNA操作區，或安裝一臺Ⅱ級生物安全柜或外排風式的排風櫥來替代。

（3）PCR反應配制區：本區的功能為配制、分裝PCR主反應混合液以及加入核酸模板。對于使用巢式PCR進行檢測的實驗室，建議在此區安裝一臺Ⅱ級生物安全柜或外排風式的排風櫥，，第一輪的擴增產物添加至第二輪的主反應混合液的操作可在此區進行。

（4）擴增區：核酸擴增。加了DNA或RNA等模板的反應管應蓋好管蓋后才拿到本區。

（5）擴增產物分析區：本區的功能為擴增片段的測定。本區是最主要的擴增產物污染來源，應注意避免通過本區的物品將擴增產物帶出。對于使用定量PCR進行檢測的實驗室，此產物分析區可以省略。

二、以上各區域擁有明確的標記。進入各工作區域應盡量按單一方向進行，即試劑配制和貯存區、樣品制備區、PCR反應配制區、擴增區和擴增產物分析區。

三、每個工作區域內都應有專項使用的設備，包括加樣設備，如移液器、吸頭等。適當時，可以用顏色或其他方式對不同區域內的實驗用品加以區分，并避免不同工作區域內的設備和實驗用品混用。

四、適宜時，實驗室內可配置便攜式紫外消毒裝置，用于各工作區域內的實驗表面、臺面、地面等的紫外消毒。

五、定期對擴增產物分析用1mol/L的鹽酸擦拭臺面，以防擴增產物的污染。用過的電泳凝膠和電泳緩沖液要集中處理。