全自動(dòng)高內(nèi)涵成像分析系統(tǒng)應(yīng)用

——腫瘤學(xué)研究：細(xì)胞周期及凋亡全自動(dòng)分析

 摘要 

        在腫瘤學(xué)研究及治療過(guò)程中，監(jiān)控細(xì)胞周期及凋亡的狀態(tài)是一個(gè)非常重要的指標(biāo)。 與傳統(tǒng)的檢測(cè)方法相比，如流式細(xì)胞FACS，全自動(dòng)高內(nèi)涵成像分析系統(tǒng)可對(duì)原位（無(wú)需消化懸浮處理）細(xì)胞進(jìn)行全自動(dòng)成像，并完成單個(gè)細(xì)胞水平的多參數(shù)分析。MetaXpress^TM圖像分析及獲取軟件具有一系列常用且操作簡(jiǎn)單的應(yīng)用分析模塊。AcuityXprss^TM細(xì)胞生物學(xué)分析軟件可對(duì)高內(nèi)涵成像分析產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化管理及數(shù)據(jù)挖掘。

        MetaXpress軟件中的細(xì)胞周期分析模塊，就是專門為細(xì)胞周期及凋亡分析開(kāi)發(fā)的應(yīng)用模塊[Fig 1]。該模塊采用自適應(yīng)背景扣除技術(shù)（Adaptive Background Correcton^TM, ABC），排除因樣品制備等原因帶來(lái)的背景不均勻的問(wèn)題，準(zhǔn)確的將細(xì)胞與背景區(qū)分開(kāi)來(lái)。該模塊可對(duì)簡(jiǎn)單的均質(zhì)DNA染料（如DAPI/Hoechst/PI）染色后的細(xì)胞進(jìn)行細(xì)胞周期狀態(tài)分析[Fig 2-3]，也可用更準(zhǔn)確的有絲分裂和/或凋亡標(biāo)志物進(jìn)行分析[Fig 1]。

Fig 1: 細(xì)胞周期分析模塊界面

Fig 2. 根據(jù)每個(gè)細(xì)胞內(nèi)DNA含量-總熒光強(qiáng)度，在2N和4N的雙峰圖中設(shè)定閾值，確定G0/G1，S，G2期。

Fig 3. 單色DNA染料標(biāo)記下，可根據(jù)每個(gè)細(xì)胞內(nèi)染色體的聚集度-平均熒光強(qiáng)度，設(shè)定處于分裂期細(xì)胞的閾值，確定處于分裂期的細(xì)胞，結(jié)合2N/4N參數(shù)，進(jìn)一步確定分裂早期Early M及晚期 Late M。

        下面的實(shí)例中，我們將用陽(yáng)性化合物處理細(xì)胞后，分析其對(duì)細(xì)胞周期及凋亡狀態(tài)的影響。我們將用MetaXpress軟件中的細(xì)胞周期模塊，展示一個(gè)集快速、簡(jiǎn)單、靈活性為一體的細(xì)胞周期及凋亡分析方法。

材料及方法

樣品制備

1. 前列腺癌Du145細(xì)胞以8,000/孔接種于96孔板中。
2. 分別將紫杉醇Taxol和星形孢菌素Staurosporine以一定的濃度梯度處理細(xì)胞24小時(shí)。
3. 將細(xì)胞固定，并分別用Hoechst33342（Invitrogen）、anti-phospho Histone H3ser10 （Upstate）（Texas Red 標(biāo)記二抗） 和anti-cleaved PARP （Cell Signaling） （FITC標(biāo)記二抗 ）染色。

圖像獲取

1． 使用ImageXpress Micro高內(nèi)涵成像儀器，通過(guò)MetaXpress軟件自帶標(biāo)準(zhǔn)Protocol，對(duì)96孔板分別用10倍平場(chǎng)半復(fù)消色差物鏡和20倍平場(chǎng)半復(fù)消色差物鏡全自動(dòng)獲取圖像。

2． 每孔獲取4個(gè)視野圖像。

運(yùn)用細(xì)胞周期模塊對(duì)獲取的圖像進(jìn)行分析

1． 選擇標(biāo)記DNA的圖像：Hoechst 標(biāo)記細(xì)胞核，反映DNA含量及結(jié)構(gòu)。

2． 設(shè)定細(xì)胞核的大小范圍及與背景熒光強(qiáng)度對(duì)比值。

3． 設(shè)定分裂期細(xì)胞參數(shù)：通過(guò)染色標(biāo)記的DNA強(qiáng)度界定或有絲分裂標(biāo)志物（anti-phospho Histone H3ser10）界定。

4． 通過(guò)凋亡標(biāo)記物（anti-cleaved PARP）設(shè)定處于凋亡狀態(tài)的細(xì)胞。

5． 預(yù)覽分析結(jié)果，互動(dòng)方式調(diào)整分析參數(shù)。

6． 對(duì)所有圖像進(jìn)行自動(dòng)化分析。

數(shù)據(jù)處理

1． 分析數(shù)據(jù)導(dǎo)入Excel軟件中進(jìn)行分析。

2． 運(yùn)用高內(nèi)涵生物信息學(xué)軟件AcuityXpress對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘，包括曲線擬合、IC50/EC50計(jì)算及Hit selection等。

Fig 4. 運(yùn)用細(xì)胞周期模塊進(jìn)行圖像分析，根據(jù)DNA含量及結(jié)構(gòu)對(duì)細(xì)胞所處的周期狀態(tài)進(jìn)行分析。分析結(jié)果圖像與原始圖片對(duì)比圖： a) 20X  原始圖片， b) 20X 分析圖片， c) 10X原始圖片， d) 10X分析圖片。

Fig 5. 在10倍和20倍物鏡獲取或不同染色標(biāo)記分析的情況下，藥物處理之后的藥效結(jié)果一致。DNA Avg. Intensity 或 DD 表示運(yùn)用DNA平均熒光強(qiáng)度界定分裂期細(xì)胞。H3s10表示用特異性分裂期標(biāo)志物 （anti-phospho Histone H3ser10）界定分裂期細(xì)胞。 A 表示凋亡Apoptosis， M 表示分裂mitosis。

結(jié)論

1． 細(xì)胞周期分析模塊可進(jìn)行準(zhǔn)確的細(xì)胞核及細(xì)胞狀態(tài)分析

2． 細(xì)胞周期分析模塊參數(shù)設(shè)置簡(jiǎn)單、操作方面、可通過(guò)柱型圖和散點(diǎn)圖互動(dòng)調(diào)節(jié)參數(shù)。

3． 用10倍和20倍物鏡獲得的最終數(shù)據(jù)，其分析結(jié)果一致。

4． 分別運(yùn)用DNA熒光強(qiáng)度定義分裂期細(xì)胞與分裂期特異性標(biāo)志物定義分裂期細(xì)胞，兩種方法分析結(jié)果一致。