純水系統（反滲透及蒸餾水系統）需使用普通城市自來水作為供水。由于自來水在供水過程中存在二次污染或者自來水水源受到嚴重污染，可以導致用戶管道的供水水質極度下降，為了有效的防止這種污染對純水系統的關鍵元件造成不可逆的破壞，需要根據用戶的管道供水水質選擇適當的預過濾保護裝置。裝置的主要凈化功能應該包括：

降低污泥指數，降低余氯含量，降低水硬度（令LSI為負值）

此裝置也可以有效地降低用戶的純水系統使用成本。用戶需要及時更換預過濾保護裝置的過濾元件，確保裝置的有效性。

 

純水系統電源：

   純水系統應該安裝在電源穩定的場所。如果電源不穩定，可能對系統功能造成不利影響，嚴重時可能會燒毀系統主板。

 

純水系統場地：

   超純水系統應該安裝在盡可能潔凈的實驗室，以確保其超純水產水不被二次污染。純水系統的安裝場地需要適當接近上、下水管道，并且要保持安裝點的通風、干燥，避免陽光直接照射。

 

純水系統維護：

   ※ 用戶應按照廠家工程師和純水系統本身的提示定期更換純化柱，并留意系統的報警提示。并根據用戶手冊的要求與服務工程師聯系。
   ※ 純水系統日常使用時，應盡可能的持續使用，保持電源和水源的正常供應。但是，由于特殊原因純水系統不得不長時間停止使用時，可以參考以下方法：

 

   如果因為實驗室整修或是長時間休息，造成純水、超純水系統長期停用時，為了將來可以使實驗正常進行，必須施行一定的應對措施。

   若停用期為1星期到10天，且電源及水源不受影響，就可以讓系統保持運作狀態，就能繼續獲得安定的純化水質。若是進行水管工程，則系統一定要完全停止。這時候應關閉純水系統的供水開關與電源，并拆卸與供應水之間的連接。而水箱中的純水，由于長時間靜置將造成水質的劣化，因此要完全排空。

   停用期結束后，如再度使用系統時應注意，尤其是水管工程修復后，由于供給水中會混有許多的污染物質，因此，應先將供水來源的水龍頭打開充分排水使水質穩定后，再打開與系統相連結的進水開關，來啟動系統。此一程序可以防止大量的污染物質流入系統之中。

   如果采取前述對策后系統仍不能正常的運作，這可能是停用期間各種純化柱與濾膜受到阻塞所引起的。因此，應將有問題的部分加以更換。

 

   純水系統取水時，應注意避免被二次污染。尤其是超純水系統地產水極易被污染，所以，取用超純水時，應該做到即取即用，避免儲存。

 

   及時更換低成本的預處理柱是降低使用成本的有效方法。對于超純水系統而言，可以通過定期的校驗系統內置的電阻率監測器，確保電阻率的讀數正確，并根據電阻率監測器的數據和超純化柱的使用時間（一般不超過2年）來決定是否更換超純化柱。