培訓班介紹

隨著我國精準醫療計劃的全面啟動，包括腫瘤、心腦血管、代謝性疾病、免疫性疾病及罕見病等多種高發重大疾病被列入精準醫學的研究范疇，通過對基因組、轉錄組、蛋白質組及代謝組等多組學數據的深度整合和深度挖掘，并結合多種臨床數據，希望實現精準的疾病分類和診斷，制定具有個性化的疾病預防和診療方案。在邁向精準醫療的道路上，蛋白質組學扮演了重要的角色：它是基因組的表型，更接近生命活動的當下狀態，更合適作為一個動態的生化指標，更直接地判斷疾病的發生和發展！隨著腫瘤研究領域基因組與蛋白質組的深度對接，蛋白質組的臨床轉化之路在摸索中發展，在發展中加速！而高通量質譜實驗技術及數據分析方法的不斷成熟與更新，進一步激發了蛋白質組學在精準醫學領域的發力和突破！

為了更好地交流分享基于蛋白質譜的蛋白質組學在精準醫學領域的新實驗技術、數據分析方法，以及具有代表性的應用實例，賽默飛世爾科技與上海康昱盛公司以及克里克學院合作推出了本次培訓班，于2016年7月9日-10日、16日-17日、30日-31日，分別于上海、北京和廣州舉辦。培訓課程包括基礎課程和應用課程兩個部分，邀請了中國科學院計算技術研究所蛋白質譜數據算法專家、賽默飛世爾資深應用科學家、康昱盛公司高級應用科學家，為大家講授從樣品制備、質譜實驗到數據處理、深度分析以及相關數據庫使用的基礎知識，并有幸邀請到分別來自復旦大學醫學院、上海交通大學醫學院、北京協和醫學院、清華大學生命科學學院、暨南大學生命科學技術學院的多位專家教授，為大家介紹前沿的臨床應用，分享他們多年沉淀的寶貴科研經驗和令人矚目的科研成果！

本次培訓班面向對蛋白質組學感興趣的醫學及臨床科研人員，以及參與臨床合作研究的蛋白質組學基礎科研人員以及生物信息學研究人員，同時歡迎有志于投身臨床蛋白質組學及精準醫學領域的研究生及本科高年級學生。為滿足廣大同行的培訓需求，同時控制人數，保證培訓質量，本次培訓班計劃在上海、北京及廣州各辦一場，每場時間為兩天，第一天及第二天下午的課程相同，第二天上午應用課程的授課老師和授課內容各不相同，請有意報名的學員注意查看每一場課程安排的詳細情況，以便選擇最合適自己的場次。若有任何問題，歡迎通過電話或郵件等方式聯系組委會工作人員，我們會竭誠為您服務，并熱烈期盼您的參加！

 

8:00 – 9:00             注冊

9:00 – 9:15            開班儀式

9:15 – 10:00    臨床蛋白質組學樣品前處理

                 —臨床細胞、組織樣本前處理

                 —臨床體液樣本前處理（血漿、尿液等）

                 —臨床小量樣本前處理（LCM等）

                 —蛋白質復合物免疫沉淀

                 —蛋白質酶解、除鹽、分級等

                 —修飾肽段富集（磷酸化、糖基化等）

                 —蛋白質組學定量方法

10:00 – 10:45   臨床蛋白質組學質譜分析一

                 —蛋白質質譜分析基礎

                 —Oribtrap質譜技術簡介

                 —未知蛋白質與后修飾鑒定

10:45 – 11:00            茶歇

11:00 – 12:00   臨床蛋白質組學質譜分析二

                 —表達差異比較與標記物發現

                 —樣本數字化與標志物驗證

                 —目標蛋白定量與臨床檢測

12:00 – 13:30         午餐及午休

13:30 – 14:15   蛋白質質譜數據基礎知識

                 —蛋白質質譜數據類型及格式

                 —蛋白質質譜譜圖原理及介紹

                 —蛋白質質譜數據采集策略介紹

14:15 – 15:15   蛋白質定性數據解析要點

                 —肽譜匹配基本原理 

                 —搜庫參數設置優化 

                 —譜圖信息的深度解析

15:15 – 15:30           茶歇

15:30 – 16:15   蛋白質定量數據解析要點

                 —定量技術介紹  

                 —定量算法及軟件介紹  

                 —精確定量面臨的挑戰

16:15 – 17:00   數據解析流程及統計分析 

                 —肽段到蛋白質的歸并

                 —顯著性計算及差異表達蛋白質

                 —論文中常見的統計描述錯誤及更正方法

17:00 – 17:30          答疑

 

9:00 – 10:20       專題報告：

                    Finding Molecular Mechanisms underlying Tumorigenesis and 
                    Progression from Proteomic Data （北京站）

                

10:20 – 10:40      茶歇

10:40 – 12:00      專題報告：

                    尿液是早期敏感的生物標志物來源（北京站）

                

12:00 – 13:30      午餐及午休

13:30 – 14:45      蛋白質組學常用數據庫及使用方法

                    —介紹常用的蛋白質組學數據庫的特點，應用范圍及操作方法

14:45 – 15:45      蛋白質數據的深度注釋與生物通路分析

                    —蛋白功能注釋與生物學效應分析

                    —蛋白質的功能異常與疾病的關聯

                    —蛋白與蛋白及蛋白與小分子相互作用網絡

                    —蛋白上游調節因子

15:45 – 16:00      茶歇                          

16:00 – 17:00      蛋白質組學與其它組學數據的關聯分析

                    —蛋白質組學與轉錄組學關聯分析

                    實例解析

                    —蛋白質組學與代謝組學關聯分析

                    實例解析

17:00 – 17:30      答疑