上海市生物信息學會（Shanghai Society for Bioinformatics，縮寫SSBI）成立于2005年6月，是上海市科學技術協會下屬的地方性學術團體，依托單位為上海生物信息技術研究中心。

 

上海生物信息技術研究中心在系統建模、定量組學數據獲取、分析、數據整合及其相互作用網絡分析技術平臺建設方面取得了一系列國內外矚目的研究成果。在此基礎上，近年來又建立了新一代測序技術平臺，以及依托Thermo Q Exactive、AB QTRAP 4000等儀器的質譜技術平臺，能夠開展基因組、甲基化組、轉錄組、蛋白質組、代謝組等不同層次的一站式高通量檢測及數據分析。

 

上海市藥物轉化工程技術研究中心成立于2014年，致力于發展高效、低毒、個性化腫瘤治療方案和藥物研發技術體系，推動轉化醫學的發展。

 

主辦單位：上海市生物信息學會

協辦單位：上海藥物轉化工程技術研究中心 上海生物信息技術研究中心 蘇州貝斯派生物科技有限公司 上海麥其知識產權代理事務所

 

會議地點：上海浦東新區科苑路1300號浦東國際人才城2樓智音廳（曙光醫院對面）

 

開班時間：11月12日（周四）-11月14日（周六）

 

 

日期	課程名稱	課程內容	時間
11月12日 （星期四）	報道-開班儀式	生物信息中心介紹	8:30-9:00
	蛋白質組學實驗設計及數據分析	蛋白質組學—樣本處理和實驗方法 蛋白質組學的方法和進展 蛋白質組學—搜庫及差異蛋白篩選 （Maxquant上機操作）	9:00-12:00
	代謝組學實驗設計及數據分析	代謝組學實驗設計及樣本處理 代謝組學數據處理－多維統計分析（SIMCA-P上機操作）	13:30-17:00
11月13日 （星期五）	轉錄組數據分析	有referecnce轉錄組數據分析 無reference轉錄組數據分析 轉錄組高級數據分析（聚類、網絡構建等）	9:00-12:00
	蛋白質結構與功能分析	蛋白質結構預測與變異分析 分子對接與虛擬篩選	13:30-15:00
	多組學數據整合分析	多組學數據整合分析案例	15:45-16:30
	參觀、合影	參觀上海生物信息技術研究中心	16:30-17:00
11月14日 （星期六）	組學分析常用軟件上機練習	GO和KEGG注釋分析,熱圖繪制與聚類分析、ROC分析等常用方法Cytoscape、Mev、 HemI、STRING、DAVID、KOBAS等軟件使用	9:00-12:00
	科研工作中的專利挖掘和專利保護		13:30-16:00

注：1.課程具體安排以報名當天的課程表為準；

2.因需上機練習，請自帶筆記本電腦，默認是windows系統，若安裝的是linux或蘋果iOS請自行下載上機軟件。

 

1.      吳謙博士，副研究員，上海生物信息技術研究中心質譜實驗室負責人。本科、碩士畢業于復旦大學化學系，博士畢業于上海交通大學藥學院。從事質譜研究與開發十余年，曾在某知名上市藥企從事新藥研發工作，參與十余個一類新藥項目及部分重組蛋白藥物研發。主要研究方向為蛋白質組學、代謝組學及質譜定量分析新方法開發，發表論文10余篇，在基于LC-MS技術的代謝組學特別是脂質組學檢測實驗與分析方面具有豐富經驗。

 

2.      庫鑫博士，上海交通大學系統生物醫學研究院講師。本科畢業于華中科技大學同濟醫學院，碩士畢業于中科院上海藥物研究所，博士畢業于德國慕尼黑工業大學（Technische Universität München）生物分析與蛋白質組學研究所（Prof. Bernhard Kuster）。長期從事腫瘤蛋白質組學的相關研究，在國際期刊上發表過多篇相關論文。目前研究方向為腫瘤相關生物標志物的發現和蛋白質糖基化修飾。

 

3.      李君一博士，中國科學院上海生命科學研究院系統生物學國家重點實驗室博士后。本科畢業于北京大學物理學院，碩士畢業于美國新澤西州立羅格斯大學統計學系，博士畢業于羅格斯大學生物物理專業。隨后在羅格斯大學進行生物信息學博士后研究。2013年起在中國科學院上海生命科學研究院系統生物學國家重點實驗室繼續生物信息學博士后工作。研究方向為運用統計算法及數理模型，從高通量數據出發，解決遺傳學和表觀遺傳學問題。近幾年專注于復雜疾病（如癌癥、糖尿病等）相關的高通量轉錄組數據分析。

 

4.      戴文韜博士，上海生物信息技術研究中心轉化醫學平臺生物信息負責人。本科畢業于華東師范大學生命科學院，博士畢業于中科院生物物理所。從事生物信息學研究多年，利用數據挖掘和機器學習方法從事生物大分子模擬分析，組學數據分析挖掘等工作。發展了進行蛋白結構模型質量評估和蛋白相互作用界面預測的算法，開發了在國內處于最高精度的蛋白結構預測服務器。

 

5.      董紅曼律師，專利代理人，上海麥其知識產權代理事務所的創始合伙人。本科、碩士畢業于華東師范大學生物化學專業，同時獲上海交通大學法律碩士。國際保護知識產權協會、國際商標協會、全國專利代理人協會、技術經紀協會會員。執業領域以知識產權法律為主，為海內外企業提供中國及外國的專利商標事務，包括申請、復審、無效、異議、維權訴訟，以及商業并購中的技術轉讓許可等法律事務。

 

6.      李園園博士，研究員，上海生物信息技術研究中心系統生物學課題組長，上海生物醫學研究院生物醫學轉化應用中心副主任，上海藥物轉化工程技術研究中心執行主任，上海生物信息學會理事。本科畢業于南開大學，碩士畢業于協和醫科大學腫瘤研究所，博士畢業于中科院上海生化細胞所。研究方向為生物信息學，系統生物學，轉化醫學。在PLoS Computational Biology、Bioinformatics、Molecular Systems Biology等國際權威專業期刊上發表論文50余篇，其中第一或通訊作者30余篇。獲軟件著作權7項，發明專利授權3項。擔任國家自然科學基金評審專家，任PLoS Computational Biology、PLoS ONE、BMC Systems Biology、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Gene、中國科學等10余家專業期刊審稿人。作為項目負責人承擔多項國家自然科學基金面上項目、973項目、863項目、上海市科委重大項目等。2006年上海市科技啟明星。2013年明治生命科學獎。

 

三、費用：

會議費用：3500元/人

在校學生持學生證： 3000元/人

說明：以上費用含證書（上海生物信息學會頒發）、材料、稅金、午餐、茶點

 

如您計劃參加，可以登錄上海生物信息技術研究中心網站（http://www.scbit.org）查看詳細內容或登錄科學網、丁香園等網址查詢或聯系當地培訓負責人。