10x Genomics發(fā)布新品：首款Visium儀器CytAssist
近幾年，空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展如火如荼，由于其應(yīng)用前景廣闊，已成為生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。作為一家飛速發(fā)展的公司，10x Genomics公司一直致力于研發(fā)新技術(shù)，不斷推出新產(chǎn)品，擴(kuò)充產(chǎn)品線，其開發(fā)的Visium空間基因表達(dá)解決方案將組織學(xué)與空間分辨率的全轉(zhuǎn)錄組分析相結(jié)合，可在組織背景下對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行定位和定量。
FFPE樣本是臨床上十分常見的研究材料，可以長期保存病理樣本，由于其可以溯源如疾病診斷、預(yù)后等臨床信息，有很高的臨床科研價(jià)值，但核酸降解嚴(yán)重、存在分子交聯(lián)，使其成為珍貴但同時(shí)富有挑戰(zhàn)的樣本類型。為了解決FFPE樣本降解嚴(yán)重的問題，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表達(dá)解決方案初代產(chǎn)品，可以對(duì)長期保存的FFPE組織樣本的全轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析，并具有完整的組織覆蓋度，可重新分析長期保存的生物庫樣本以發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物，或開展回顧性研究和縱向研究。
為了解鎖更多場(chǎng)景下的FFPE樣本，如被貼在普通玻片上的歸檔樣本、大面積的組織樣本、計(jì)劃先對(duì)樣本進(jìn)行初篩選定感興趣區(qū)域后再進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)等，10x Genomics于近日發(fā)布了首款Visium儀器CytAssist，這是一款小型臺(tái)式儀器，它可以將普通玻片上FFPE組織的轉(zhuǎn)錄組分析物轉(zhuǎn)移到10x Visium基因表達(dá)玻片上，從而架起組織學(xué)與基因組學(xué)的橋梁。
FFPE樣本是臨床上十分常見的研究材料，可以長期保存病理樣本，由于其可以溯源如疾病診斷、預(yù)后等臨床信息，有很高的臨床科研價(jià)值，但核酸降解嚴(yán)重、存在分子交聯(lián)，使其成為珍貴但同時(shí)富有挑戰(zhàn)的樣本類型。為了解決FFPE樣本降解嚴(yán)重的問題，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表達(dá)解決方案初代產(chǎn)品，可以對(duì)長期保存的FFPE組織樣本的全轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析，并具有完整的組織覆蓋度，可重新分析長期保存的生物庫樣本以發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物，或開展回顧性研究和縱向研究。
為了解鎖更多場(chǎng)景下的FFPE樣本，如被貼在普通玻片上的歸檔樣本、大面積的組織樣本、計(jì)劃先對(duì)樣本進(jìn)行初篩選定感興趣區(qū)域后再進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)等，10x Genomics于近日發(fā)布了首款Visium儀器CytAssist，這是一款小型臺(tái)式儀器，它可以將普通玻片上FFPE組織的轉(zhuǎn)錄組分析物轉(zhuǎn)移到10x Visium基因表達(dá)玻片上，從而架起組織學(xué)與基因組學(xué)的橋梁。
10x Genomics提供從儀器設(shè)備、試劑耗材到分析軟件的完整解決方案。此款助力型儀器與H&E染色或免疫熒光染色（IF）的FFPE樣本兼容，配套使用的Visium玻片具有2個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域面積為6.5mm*6.5mm或者11mm*11mm，兩款開源的用戶友好型軟件Space Ranger及Loupe Browser可進(jìn)行下游數(shù)據(jù)處理分析及可視化展示。
對(duì)置于普通標(biāo)準(zhǔn)載玻片上的FFPE樣本進(jìn)行脫蠟和成像處理后，進(jìn)行解交聯(lián)和探針雜交，然后將兩張標(biāo)準(zhǔn)載玻片和一張含兩個(gè)捕獲區(qū)域的Visium玻片放入CytAssist儀器中，使標(biāo)準(zhǔn)玻片上的組織切片與Visium玻片上兩個(gè)捕獲區(qū)域的頂部對(duì)齊。儀器捕獲明場(chǎng)圖像以提供空間定位用于校準(zhǔn)及數(shù)據(jù)分析，然后將轉(zhuǎn)錄組分析物與Visium玻片雜交，從而實(shí)現(xiàn)組織轉(zhuǎn)錄組分析物從普通玻片到Visium玻片的轉(zhuǎn)移，后續(xù)探針延伸及文庫構(gòu)建等操作與Visium FFPE標(biāo)準(zhǔn)流程相同，在儀器外即可完成。
10x Genomics還對(duì)Visium FFPE的初代產(chǎn)品進(jìn)行了升級(jí)，升級(jí)到v2.0版本的產(chǎn)品包含全新設(shè)計(jì)的玻片和試劑，可適配于Visium CytAssist儀器。
升級(jí)后的Visium FFPE v2.0產(chǎn)品具有以下幾個(gè)特性：
① 升級(jí)后的玻片對(duì)組織的粘附性更高，不用再做預(yù)測(cè)試即可開展正式實(shí)驗(yàn)
② 采用了新的探針設(shè)計(jì)，對(duì)于約90%的基因設(shè)計(jì)了三對(duì)探針對(duì)，對(duì)于一些高表達(dá)的基因設(shè)計(jì)了一對(duì)探針，具有高靈敏度和高特異性
③ 提供商業(yè)化的35種蛋白組合試劑盒，可以對(duì)同一FFPE樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)的同時(shí)分析，對(duì)基因表達(dá)檢測(cè)的同時(shí)檢測(cè)幾十種蛋白
④ 檢測(cè)范圍拓寬：質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)為DV200>30%，可檢測(cè)更多高降解度的樣本
⑤ 配置升級(jí)：新增加了大面積11mm*11mm捕獲區(qū)域，解鎖更多可能性。
① 升級(jí)后的玻片對(duì)組織的粘附性更高，不用再做預(yù)測(cè)試即可開展正式實(shí)驗(yàn)
② 采用了新的探針設(shè)計(jì)，對(duì)于約90%的基因設(shè)計(jì)了三對(duì)探針對(duì)，對(duì)于一些高表達(dá)的基因設(shè)計(jì)了一對(duì)探針，具有高靈敏度和高特異性
③ 提供商業(yè)化的35種蛋白組合試劑盒，可以對(duì)同一FFPE樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)的同時(shí)分析，對(duì)基因表達(dá)檢測(cè)的同時(shí)檢測(cè)幾十種蛋白
④ 檢測(cè)范圍拓寬：質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)為DV200>30%，可檢測(cè)更多高降解度的樣本
⑤ 配置升級(jí)：新增加了大面積11mm*11mm捕獲區(qū)域，解鎖更多可能性。
Visium CytAssist儀器和FFPE v2.0產(chǎn)品現(xiàn)在均已接受訂購，早下單早發(fā)貨！歡迎通過如下方式聯(lián)系我們，電話: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。
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