近來，已有多篇文章報道了生物醫(yī)學研究數(shù)據(jù)的激增。到目前為止，基因組測序數(shù)據(jù)只是其中的冰山一角。研究人員也會不斷產(chǎn)生RNA測序數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)組學、單細胞分析、表型（性狀）數(shù)據(jù)及其他更多類型數(shù)據(jù)。

從人類患者本身，到酵母、蠕蟲和果蠅等多種物種，數(shù)據(jù)從無數(shù)的課題和條件中（例如，癌癥中的RNA剪接、涉及阿爾茲海默癥tau紡錘體、2型糖尿病中的胰島功能障礙等）累積。對于小鼠來說，當然也有這種大量數(shù)據(jù)的累積。

然而，每個孤立的數(shù)據(jù)集都無法完全解決研究人員的大多數(shù)問題，尤其是對于那些需要更多研究信息的復雜的過程、條件和疾病來說，更是如此。為了加速問題研究進程，有必要從研究跨物種特定問題的不同實驗室收集實驗數(shù)據(jù)。

可現(xiàn)實中存在著各種各樣的障礙，如從共享意愿的阻礙因素到不兼容的數(shù)據(jù)格式，這些障礙都使我們無法充分利用大量涌現(xiàn)的現(xiàn)代數(shù)據(jù)。
 
 
GeneWeaver是一套可以克服這些障礙的系統(tǒng)。研究人員可通過該系統(tǒng)整合數(shù)據(jù)，并使用各種分析工具來解析結(jié)果。

GeneWeaver整合和存儲了實驗性基因組數(shù)據(jù)，包括：
▲ 主要的發(fā)表文章
▲ 外部數(shù)據(jù)庫
▲用戶提交的數(shù)據(jù)集

該數(shù)據(jù)庫可促進研究人員對跨物種和數(shù)據(jù)格式的數(shù)據(jù)以大數(shù)據(jù)分析的方式進行分析。

近日，杰克森實驗室的Elissa Chesler教授（博士）和研究員Jason Bubier博士領(lǐng)導的研究小組利用GeneWeaver分析了幾個與老年學問題相關(guān)的衰老研究數(shù)據(jù)，展示了該系統(tǒng)的強大能力。
 
在發(fā)表于PLoS One的一篇文章“Integration of heterogeneous functional genomics data in gerontology research to find genes and pathways underlying aging across species”中，研究人員發(fā)現(xiàn)了影響長壽的信號通路和新的保守基因
 
 
GeneWeaver
GeneWeaver 是一個異質(zhì)性功能基因組數(shù)據(jù)綜合分析平臺，可在全球功能基因組學分析中，對多個物種生物功能相關(guān)的基因、基因產(chǎn)物和基因變異，支持用戶比較和對比這些生物功能。
 
 
在研究人員已開展的衰老相關(guān)研究中，包括熱量限制延長壽命的信號通路（已被證明可以延長多種物種的壽命），以及延長特定物種壽命的藥物。將基因組研究中發(fā)現(xiàn)的跨物種基因（同源基因）與受Sirolimus-雷帕霉素（小鼠）和3,4,4 ' -三羥基二苯乙烯白藜蘆醇（果蠅）影響的基因進行結(jié)合分析，得到了一個涉及所有通路的常見基因HSPA1A。
 
HSPA1A是HSP70復合體的一部分，之前已被證明與衰老和壽命相關(guān)。關(guān)注這個特殊的基因?qū)�會獲得進一步的研究進展。
 
該研究小組還整合了來自6個物種（酵母、蠕蟲、果蠅、大鼠、小鼠、人類）的73 個衰老相關(guān)基因的數(shù)據(jù)，用于分析高度保守的衰老相關(guān)基因。研究發(fā)現(xiàn)，與衰老聯(lián)系最緊密的基因 (Cd63) 存在于4個物種的12個基因集中，這為它在衰老機制中的作用提供了強有力的證據(jù)。
 
在與研究人員的合作中，在蠕蟲中敲除了它的同源基因以驗證這一發(fā)現(xiàn)，結(jié)果觀察到蠕蟲的平均壽命延長了10.5%。盡管尚沒有該基因的變異對人類衰老影響的記錄，但這個結(jié)果提示Cd63的作用有待進一步研究。
 
   
隨著更多可用數(shù)據(jù)的產(chǎn)生（包括本文中分析的與衰老相關(guān)的功能性基因組數(shù)據(jù)），大數(shù)據(jù)的整合和分析將變得越來越重要。

隨著GeneWeaver數(shù)據(jù)庫中納入數(shù)據(jù)集數(shù)量和種類的持續(xù)增長，其實用性和功能性也在不斷增長。

未來，數(shù)據(jù)資源聚合和分析方面的進展將為研究人員對衰老及其他健康和疾病相關(guān)過程發(fā)現(xiàn)新機制的趨同性分子證據(jù)提供便利。
 

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源于近百年的專業(yè)積累, JAX深知健康優(yōu)質(zhì)的小鼠模型對高質(zhì)量可重復數(shù)據(jù)的重要性。
 
JAX在老齡化疾病相關(guān)研究領(lǐng)域： 
★ 不僅致力于提供精準可靠模型小鼠——C57BL/6J老齡鼠，憑借專利的GSP控制遺傳漂變和嚴格的GQC控制遺傳質(zhì)量等特點，可現(xiàn)貨批量供應(yīng)超高品質(zhì)最大周齡90周的精準可靠老齡鼠模型，目前已是最被廣泛使用的老齡鼠。
 
★ 同樣注重創(chuàng)新性前沿研究：例如， JAX老齡化研究中心和JAX印第安納大學阿爾茨海默癥精準模型中心均已取得了豐碩研究成果。其中，老齡化相關(guān)表征信息，也已存儲至JAX小鼠表型信息數(shù)據(jù)庫MPD（ The Mouse Phenome Database ），可供相關(guān)研究人員參考使用。