2016年8月2日
主持人：楊 冬 朱偉民
主題：蛋白質組信息學  蛋白質鑒定
時間	主講人	培訓內容
9:00-10:00 講座	朱偉民	● 課程介紹 ● 蛋白質組學 ● 蛋白質組信息學工作流程
10:00-10:45 講座	朱偉民	工作流原理 ● 序列數據庫 ● 肽段鑒定 ● 蛋白組裝 ● 蛋白定量 ● 質量控制和標準
10:45-11:00	茶歇
11:00-11:45 講座	楊 冬	工作流原理 ●  翻譯后修飾 ● 數據挖掘 ● 數據注釋 ● 聚類和其他分析
11:45-12:30 練習	楊 冬	常用的生物信息數據庫和工具
12:30-13:30	午餐
13:30-14:30 講座	楊 冬	Mascot：實踐中的搜索工具
14:30-15:15 練習	楊 冬	搜索工具的環境
15:15-15:30	茶歇
15:30-16:30 講座	楊 冬	搜索工具實際應用
16:30-17:15 講座	朱偉民	數據依賴采集 (DDA) ● 數據非依賴采集(DIA)
17:15-18:00	BBQ和墻報展示
2016年8月3日
主持人：朱云平
主題：定量蛋白質組
時間	主講人	培訓內容
9:00-10:00 講座	常 乘	標記定量蛋白質組學：precursor標記方法
10:00-10:45 講座	常 乘	標定定量蛋白質組學：isobaric 標記方法
10:45-11:00	茶歇
11:00-11:45 練習	常 乘 馬 潔 馮曉東	MaxQuant標記定量上機練習
11:45-12:30 練習	常 乘 馬 潔 馮曉東	練習
12:30-13:30	午餐
13:30-14:30 講座	常 乘	非標定量蛋白質組學
14:30-15:15 練習	常 乘	差異表達蛋白的統計分析
15:15-15:30	茶歇
15:30 講座	常 乘	PANDA和PANDA視圖介紹
16:30 練習	常 乘 馬 潔 馮曉東	PANDA和PANDA視圖
17:15	結束
2016年8月4日
主持人：馮晉文
主題：工作流  數據發布
時間	主講人	培訓內容
9:00 講座	馮晉文	TPP(trans proteome pipeline)數據分析平臺介紹
10:00 練習	馮晉文	● 基于X!Tandem肽段鑒定 ● 基于peptide Prophet肽段驗證
10:45-11:00	茶歇
11:00 練習	馮晉文	蛋白質定量 ● Libra 蛋白質組裝 ● Protein Prophet
11:45 練習	馮晉文	實際操作
12:30-13:30	午餐
13:30 講座	馮晉文	Firmiana簡介
14:30 練習	馮晉文	Firmiana上機練習
15:15-15:30	茶歇
15:30 講座	Henning Hermjakob	數據存儲與發布：ProteomeXchange
16:30 練習	馬 潔	實際操作：基于Iprox的數據存儲
17:15-18:00	參觀Phoenix center
2016年8月5日
主持人：李棟
主題：網絡和通路
時間	主講人	培訓內容
9:00 講座	李 棟	蛋白質網絡的構建與分析
10:00 講座	李 棟	蛋白質數據集深度挖掘
10:45	茶歇
11:00 練習	李 棟	網絡工具介紹： ● KEGG, Reactome ● STRING
11:45 練習	李 棟	上機練習
12:30	午餐
13:30 講座	劉中揚	Cytoscape簡介
14:30 練習	劉中揚	Cytoscape上機練習
15:15-15:30	茶歇
15:30－16:30 練習	劉中揚	Cytoscape上機練習
17:15	結束