國家基因庫正式發布自主研發的樣本庫信息管理平臺
瀏覽次數:5097 發布日期:2015-9-15
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國家基因庫發布國內先進的樣本庫信息管理平臺,助力精準醫療發展
一、國內樣本庫行業和精準醫療發展呼吁先進的信息化管理平臺
生物樣本資源庫作為一種為研究利用人體生物樣本提供資源的貯藏室,已成為支持基因組學和個體化藥物研究等的關鍵資源。但是臨床及轉化醫學中新治療方法的研發僅僅依靠儲存大量的生物樣本是不夠的,還需要獲取樣本相應的臨床、病理、影像、治療、隨訪、知情同意、生活方式等信息,所以樣本庫行業急需建立一個健全的樣本庫信息管理系統追蹤樣本的生命周期進行全程有效追蹤,獲取從樣本采集到處理、生理和臨床信息注釋、科研應用、最終到樣本銷毀的信息數據。
生物技術和計算機技術的快速發展為大規模收集如血液、尿液等人體生物樣本、存儲樣本的相關醫療信息、大量的樣本數據統計分析、生物樣本信息資源庫的信息化應用管理及不同地域間的生物樣本信息資源庫的資源交流提供了良好的平臺。針對建立、統一、資源網絡是國際樣本庫發展趨勢中的三個里程碑,然而完成“統一”的任務是發展樣本資源網絡的基礎。我國生物樣本信息建設起步較晚,使得國內的生物樣本信息資源難以實現資源共享、資源得不到充分有效的利用。目前國內大部分樣本庫信息以臨床診斷作為樣本的主要信息,如特定類別腫瘤樣本庫的主要信息局限于病患的臨床診斷結果,而個體健康信息(如飲食習慣、生活方式、家系信息等相關信息)卻可能缺失,這是國內信息化管理方面存在的問題之一,也是中國生物樣本庫信息化建設現狀的縮影。
2009年9月,美國國家癌癥研究中心(National Cancer Institute, NCI)籌劃建立了美國第一個國家級人類癌癥生物樣本信息資源庫(The Cancer Human Biobank,caHUB),該樣本庫是世界上技術最先進、管理最完善的大規模生物樣本庫之一,其為生物樣本庫的管理制定的一套先進完善的樣本庫管理規范《NCI Best Practices for Biospecimen Resources》中也提到,生物樣本庫信息管理系統是高標準樣本庫的重要組成部分。
統一的生物樣本庫信息管理平臺應以數字化、規范化、網絡化為目標,完整包含和整合樣本質控信息、樣本存儲信息、生物信息及整合了醫療機構已建立的信息系統(HIS)、電子病歷系統(EMR)等臨床信息,減少生物樣本庫多源信息化資源重疊,簡便查詢和檢索、優化流程,為臨床和科研提供可靠方便的決策信息。建立起統一的、健全的生物樣本庫信息化系統也是今后國內生物樣本庫海量數據整合的發展趨勢和必要途徑。
2015年9月4日,美國國家健康中心(NIH)宣布將投入總計4800萬美元的資金專門用于收集整合基因組信息并將其錄入至電子健康記錄系統。NIH 的這一計劃主要是為了完善電子健康病例系統以及醫療保險體系并服務于精準醫療計劃。
對于我國醫療領域來說,13億人可以形成海量的信息數據,這些數據,將成為推動國內精準醫的重要基礎,而建立標準統一的樣本信息管理平臺,則是數據信息規范收集、有效使用、擴大共享的重要基礎。
二、國家基因庫研發并發布國內先進的信息化管理平臺
由國家發改委、衛計委、財政部和工信部聯合批復成立的國家基因庫作為國內唯一的國家級基因庫,自成立之初就確定了要站在國家戰略高度為中國生命科學研究和生物產業發展提供大支撐平臺的使命和建設目標。如何提升國內樣本庫信息化管理水平自然也成為國家基因庫關注的重要項目,經過專業團隊的長時期專項研究,結合與國內知名醫療機構合作的實踐經驗,研發出了一套標準統一的樣本信息管理平臺,該套平臺既具有綜合性,整合關聯了樣本質控和存儲、臨床及生物三方面的信息,形成綜合性的貫穿數據,又具有相對獨立性,各子系統之間可獨立應用,以確保信息的安全與穩定。整個平臺包含了樣本采集和處理質量控制、樣本管理、臨床信息管理等一系列子系統:
“樣本采集&處理質量控制系統”:是目前國內第一個從樣本離體、轉運、處理到存儲進行全過程質控的信息化管理系統,系統對樣本所有質量關鍵點進行實時監控,如時間、行為及環境的監控。
“樣本管理系統”:與質量控制系統無縫連接,具有可視化的儲存、條碼化的管理、標準化的流程以及自定義具有靈活設置系統信息管。
“臨床信息管理”:靈活的數據查詢,圖表化的直觀展示。
國家基因庫構建樣本庫管理平臺的長遠目標,是希望樣本和醫療數據信息提取安全、便利,使醫療和科研工作者進行貫穿信息的標準化管理及綜合搜索、分析,真正實現數據的實用化,從而為醫療數據挖掘及醫學健康領域的科研發現提供可靠而全面的數據基礎,推動精準醫學的發展。
2015年9月15日,國家基因庫在上海的第五屆中國生物樣本庫及精準醫療國際討會上正式發布這套自主研發的樣本信息管理平臺,希望這套綜合性信息化管理平臺能夠為促進國內生物樣本庫信息化管理進程和為國內外生物、醫學領域的科研和產業發展提供專業而標準的服務。目前綜合平臺中的“樣本管理系統”已開放免費試用,您可登陸國家基因庫資源共享平臺E-BioBank申請試用: http://ebiobank.cngb.org/product_software.htm 或 聯系EBB平臺:cngb-ebb@genomics.cn
參考資料:
NCI Best Practices for Biospecimen Resources http://biospecimens.cancer.gov/practices/。