賽默飛世爾在人類蛋白質(zhì)組大會(huì)發(fā)布Proteome Dynamics
瀏覽次數(shù):3259 發(fā)布日期:2008-8-22
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世界領(lǐng)先的賽默飛世爾科技在2008年人類蛋白質(zhì)組大會(huì)(HUPO 2008)上推出新的蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程解決方案,以及兩個(gè)Thermo Scientific軟件升級(jí)包。不久前推出的Proteome Discoverer 軟件平臺(tái)是一個(gè)綜合性的、可拓展軟件平臺(tái),可以對(duì)蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)進(jìn)行定性和定量分析,作為Proteome Discoverer 的補(bǔ)充,新加入的部分將進(jìn)一步升級(jí)Thermo Scientific Proteome Dynamics。
Proteome Dynamics是一套完整的蛋白質(zhì)組解決方案,包括試劑,樣品制備試劑盒和操作流程,質(zhì)譜儀和具有特定功能的生物軟件,以方便識(shí)別,定量和定性鑒定蛋白質(zhì)。推出新品包括以下幾個(gè)方面:
•自動(dòng)化的磷酸化肽段工作流程—一套完整可自動(dòng)化分析磷酸化肽段的操作流程
•SIEVE™ 1.2---主要對(duì)軟件中無標(biāo)記差異分析部分進(jìn)行升級(jí)。基于液相色譜質(zhì)譜數(shù)據(jù)比較對(duì)蛋白和肽段的變化進(jìn)行衡量和鑒定
•ProSightPC™ 2.0—拓展了業(yè)界領(lǐng)先的自上而下的鑒定能力,支持所有高質(zhì)量準(zhǔn)確度的串聯(lián)質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)的蛋白鑒定和表征
在過去的十年里,蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域大步發(fā)展,它對(duì)生物和醫(yī)藥領(lǐng)域的尖端科技產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。
Thermo Fisher一直致力于蛋白質(zhì)組科學(xué)的發(fā)展,打破了傳統(tǒng)定性蛋白質(zhì)組分析,轉(zhuǎn)向更高級(jí)的定量蛋白質(zhì)組,因而創(chuàng)造了蛋白質(zhì)組動(dòng)態(tài)研究藍(lán)圖。
新型自動(dòng)化磷酸化肽段分析流程將Thermo Scientific技術(shù)與Pierce®磷酸化肽段富集試劑盒、Kingfisher® Flex 磁珠純化系統(tǒng)和LTQ Orbitrap™ XL ETD 雜交質(zhì)譜儀結(jié)合起來,可以完全實(shí)現(xiàn)對(duì)磷酸化肽段進(jìn)行分析。致力于構(gòu)建信號(hào)途徑的科學(xué)家會(huì)發(fā)現(xiàn)固定化金屬和金屬氧化物的親和色譜能夠富集磷酸化肽段,然后用質(zhì)譜對(duì)其分析是一個(gè)功能強(qiáng)大的技術(shù)。然而,樣品的復(fù)雜度和低通量制備步驟成為一個(gè)主要的障礙。新型Thermo Scientific的整合操作流程對(duì)這類難題提供了一個(gè)簡(jiǎn)單、有效的解決方案。“樣品制備和分析過程的每一部都是經(jīng)過優(yōu)化的。”Thermo Fisher Scientific 蛋白質(zhì)學(xué)市場(chǎng)總監(jiān)Andreas Huhmer說,“該工作流程可以使科學(xué)家實(shí)現(xiàn)整個(gè)過程無縫連接。
在2008年的人類蛋白質(zhì)組大會(huì)上發(fā)布的另一款軟件是Thermo Scientific 的SIEVE 1.2。通過比較“健康”或?qū)φ战M和“疾病”或處理不需要同位素標(biāo)記的樣品的液相色譜質(zhì)譜數(shù)據(jù)組,SIEVE可自動(dòng)對(duì)無標(biāo)記的蛋白和肽段進(jìn)行差異分析。之前,研究者只能比較成對(duì)的數(shù)據(jù)。然而,在生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的研究領(lǐng)域內(nèi),觀察數(shù)據(jù)趨勢(shì)是必須的,SIEVE 1.2 可以實(shí)現(xiàn)在單個(gè)趨勢(shì)分析中觀察多時(shí)間點(diǎn)和劑量點(diǎn)。
“SIEVE第一次發(fā)布后,我們從客戶收到反饋的主要問題是SIEVE如何根據(jù)時(shí)間不同監(jiān)控蛋白變化,如何更方便的在肽段和蛋白水平上解釋其統(tǒng)計(jì)結(jié)果。”Thermo Fisher Scientific 蛋白質(zhì)學(xué)市場(chǎng)程序經(jīng)理Amy Zumwalt說,“為了滿足這一需求,我們?cè)谶@個(gè)版本中加入了趨勢(shì)分析功能,并且完全重新構(gòu)建了用戶界面。新的向?qū)Ы缑鎸⑹共町悓?shí)驗(yàn)結(jié)果和解釋統(tǒng)計(jì)結(jié)果變得更容易。”
同樣首次發(fā)布的軟件還有Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0,它最初是設(shè)計(jì)來方便“自上而下”(top-down)蛋白質(zhì)定性鑒定。而現(xiàn)在可以支持所有高質(zhì)量精度、高分辨率的串聯(lián)質(zhì)譜蛋白實(shí)驗(yàn)。
ProSightPC 2.0可以實(shí)現(xiàn)對(duì)高質(zhì)量精度的二級(jí)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行高通量分析,無論其來自是“自上而下”(top-down),“自中而下”(middle-down),還是“自下而上”(bottom-up)的實(shí)驗(yàn),而且可表征已知的翻譯后修飾蛋白(PTM)。“Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0是專門面向雜交質(zhì)譜技術(shù)的,現(xiàn)在也可以支持新型LTQ Orbitrap XL ETD質(zhì)譜的數(shù)據(jù)。”Andreas Huhmer說,“這給研究人員提供了獨(dú)一無二的工具,可以對(duì)蛋白異構(gòu)體和變異體的錯(cuò)綜復(fù)雜的差異進(jìn)行分析。
SIEVE采用一種新型圖形界面,更易使用,而且重要的是它現(xiàn)在可以對(duì)液相色譜質(zhì)譜的數(shù)據(jù)文件自動(dòng)進(jìn)行分析。而以前在處理數(shù)據(jù)之前必須手動(dòng)挑選峰。而現(xiàn)在選擇整個(gè)色譜圖就可以對(duì)所有的峰進(jìn)行自動(dòng)分析了。
如需對(duì)Proteome Dynamics了解更多信息,請(qǐng)于2008年8月16日至20日訪問阿姆斯特丹的HUPO #34展臺(tái),或致電800-810-5118或400-650-5118,電郵analyze.cn@thermofisher.com 或者訪問 www.thermo.com/orbitrap。
Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific的一部分,是全球科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者
關(guān)于賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)
Thermo Fisher Scientific(賽默飛世爾科技)(紐約證交所代碼:TMO)是全球科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者,致力于幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年銷售額超過100億美元,擁有員工約33,000人,在全球范圍內(nèi)服務(wù)超過350,000家客戶。主要客戶類型包括:醫(yī)藥和生物公司,醫(yī)院和臨床診斷實(shí)驗(yàn)室,大學(xué)、科研院所和政府機(jī)構(gòu),以及環(huán)境與工業(yè)過程控制裝備制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific這兩個(gè)主要的品牌,幫助客戶解決在分析化學(xué)領(lǐng)域從常規(guī)的測(cè)試到復(fù)雜的研發(fā)項(xiàng)目中所遇到的各種挑戰(zhàn)。Thermo Scientific能夠?yàn)榭蛻籼峁┮徽装ǜ叨朔治鰞x器、實(shí)驗(yàn)室裝備、軟件、服務(wù)、耗材和試劑在內(nèi)的實(shí)驗(yàn)室綜合解決方案。Fisher Scientific為衛(wèi)生保健,科學(xué)研究,以及安全和教育領(lǐng)域的客戶提供一系列的實(shí)驗(yàn)室裝備、化學(xué)藥品以及其他用品和服務(wù)。賽默飛世爾科技將努力為客戶提供最為便捷的采購(gòu)方案,為科研的飛速發(fā)展不斷地改進(jìn)工藝技術(shù),提升客戶價(jià)值,幫助股東提高收益,為員工創(chuàng)造良好的發(fā)展空間。欲了解更多信息,請(qǐng)登陸: www.thermofisher.com